Protein–RNA interactions for Protein: Q5T7P8

SYT6, Synaptotagmin-6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT6Q5T7P8 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SYT6Q5T7P8 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SYT6Q5T7P8 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SYT6Q5T7P8 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SYT6Q5T7P8 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SYT6Q5T7P8 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SYT6Q5T7P8 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SYT6Q5T7P8 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SYT6Q5T7P8 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SYT6Q5T7P8 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SYT6Q5T7P8 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SYT6Q5T7P8 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SYT6Q5T7P8 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SYT6Q5T7P8 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SYT6Q5T7P8 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SYT6Q5T7P8 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SYT6Q5T7P8 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
SYT6Q5T7P8 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SYT6Q5T7P8 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SYT6Q5T7P8 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SYT6Q5T7P8 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SYT6Q5T7P8 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SYT6Q5T7P8 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SYT6Q5T7P8 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SYT6Q5T7P8 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SYT6Q5T7P8 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SYT6Q5T7P8 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SYT6Q5T7P8 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SYT6Q5T7P8 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SYT6Q5T7P8 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SYT6Q5T7P8 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
SYT6Q5T7P8 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
SYT6Q5T7P8 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
SYT6Q5T7P8 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SYT6Q5T7P8 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
SYT6Q5T7P8 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SYT6Q5T7P8 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SYT6Q5T7P8 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
SYT6Q5T7P8 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SYT6Q5T7P8 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SYT6Q5T7P8 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SYT6Q5T7P8 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SYT6Q5T7P8 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SYT6Q5T7P8 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SYT6Q5T7P8 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SYT6Q5T7P8 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SYT6Q5T7P8 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SYT6Q5T7P8 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SYT6Q5T7P8 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SYT6Q5T7P8 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SYT6Q5T7P8 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SYT6Q5T7P8 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SYT6Q5T7P8 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SYT6Q5T7P8 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SYT6Q5T7P8 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SYT6Q5T7P8 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SYT6Q5T7P8 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SYT6Q5T7P8 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SYT6Q5T7P8 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SYT6Q5T7P8 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SYT6Q5T7P8 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SYT6Q5T7P8 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SYT6Q5T7P8 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SYT6Q5T7P8 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SYT6Q5T7P8 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SYT6Q5T7P8 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SYT6Q5T7P8 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SYT6Q5T7P8 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SYT6Q5T7P8 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SYT6Q5T7P8 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SYT6Q5T7P8 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SYT6Q5T7P8 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SYT6Q5T7P8 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SYT6Q5T7P8 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SYT6Q5T7P8 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SYT6Q5T7P8 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SYT6Q5T7P8 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
SYT6Q5T7P8 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SYT6Q5T7P8 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SYT6Q5T7P8 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SYT6Q5T7P8 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SYT6Q5T7P8 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SYT6Q5T7P8 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SYT6Q5T7P8 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SYT6Q5T7P8 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SYT6Q5T7P8 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SYT6Q5T7P8 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SYT6Q5T7P8 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SYT6Q5T7P8 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
SYT6Q5T7P8 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SYT6Q5T7P8 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SYT6Q5T7P8 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SYT6Q5T7P8 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SYT6Q5T7P8 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SYT6Q5T7P8 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SYT6Q5T7P8 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SYT6Q5T7P8 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SYT6Q5T7P8 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
SYT6Q5T7P8 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SYT6Q5T7P8 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms