Protein–RNA interactions for Protein: Q5RGS3

FAM74A1, Protein FAM74A1, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM74A1Q5RGS3 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM74A1Q5RGS3 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM74A1Q5RGS3 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM74A1Q5RGS3 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM74A1Q5RGS3 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM74A1Q5RGS3 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM74A1Q5RGS3 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM74A1Q5RGS3 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM74A1Q5RGS3 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM74A1Q5RGS3 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM74A1Q5RGS3 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM74A1Q5RGS3 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM74A1Q5RGS3 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM74A1Q5RGS3 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM74A1Q5RGS3 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM74A1Q5RGS3 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM74A1Q5RGS3 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM74A1Q5RGS3 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM74A1Q5RGS3 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM74A1Q5RGS3 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM74A1Q5RGS3 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM74A1Q5RGS3 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM74A1Q5RGS3 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM74A1Q5RGS3 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM74A1Q5RGS3 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM74A1Q5RGS3 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM74A1Q5RGS3 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM74A1Q5RGS3 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM74A1Q5RGS3 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM74A1Q5RGS3 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM74A1Q5RGS3 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM74A1Q5RGS3 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM74A1Q5RGS3 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM74A1Q5RGS3 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM74A1Q5RGS3 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM74A1Q5RGS3 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM74A1Q5RGS3 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM74A1Q5RGS3 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM74A1Q5RGS3 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM74A1Q5RGS3 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM74A1Q5RGS3 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM74A1Q5RGS3 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM74A1Q5RGS3 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM74A1Q5RGS3 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM74A1Q5RGS3 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM74A1Q5RGS3 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM74A1Q5RGS3 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM74A1Q5RGS3 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM74A1Q5RGS3 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM74A1Q5RGS3 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM74A1Q5RGS3 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM74A1Q5RGS3 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM74A1Q5RGS3 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM74A1Q5RGS3 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM74A1Q5RGS3 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM74A1Q5RGS3 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM74A1Q5RGS3 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM74A1Q5RGS3 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM74A1Q5RGS3 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM74A1Q5RGS3 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM74A1Q5RGS3 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM74A1Q5RGS3 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM74A1Q5RGS3 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM74A1Q5RGS3 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM74A1Q5RGS3 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM74A1Q5RGS3 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM74A1Q5RGS3 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM74A1Q5RGS3 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM74A1Q5RGS3 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM74A1Q5RGS3 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM74A1Q5RGS3 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM74A1Q5RGS3 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM74A1Q5RGS3 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM74A1Q5RGS3 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM74A1Q5RGS3 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
FAM74A1Q5RGS3 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FAM74A1Q5RGS3 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
FAM74A1Q5RGS3 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
FAM74A1Q5RGS3 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FAM74A1Q5RGS3 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
FAM74A1Q5RGS3 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
FAM74A1Q5RGS3 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
FAM74A1Q5RGS3 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FAM74A1Q5RGS3 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
FAM74A1Q5RGS3 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FAM74A1Q5RGS3 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FAM74A1Q5RGS3 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FAM74A1Q5RGS3 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FAM74A1Q5RGS3 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
FAM74A1Q5RGS3 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM74A1Q5RGS3 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM74A1Q5RGS3 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM74A1Q5RGS3 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM74A1Q5RGS3 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM74A1Q5RGS3 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM74A1Q5RGS3 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM74A1Q5RGS3 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM74A1Q5RGS3 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM74A1Q5RGS3 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM74A1Q5RGS3 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms