Protein–RNA interactions for Protein: Q15929

ZNF56, Putative zinc finger protein 56, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF56Q15929 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
ZNF56Q15929 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
ZNF56Q15929 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
ZNF56Q15929 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
ZNF56Q15929 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
ZNF56Q15929 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
ZNF56Q15929 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
ZNF56Q15929 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
ZNF56Q15929 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
ZNF56Q15929 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
ZNF56Q15929 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
ZNF56Q15929 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
ZNF56Q15929 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
ZNF56Q15929 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
ZNF56Q15929 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
ZNF56Q15929 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
ZNF56Q15929 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC14.27□□□□□ -0.12
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ZNF56Q15929 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
ZNF56Q15929 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
ZNF56Q15929 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
ZNF56Q15929 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
ZNF56Q15929 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
ZNF56Q15929 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
ZNF56Q15929 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
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ZNF56Q15929 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
ZNF56Q15929 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
ZNF56Q15929 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
ZNF56Q15929 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
ZNF56Q15929 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
ZNF56Q15929 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
ZNF56Q15929 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
ZNF56Q15929 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
ZNF56Q15929 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
ZNF56Q15929 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
ZNF56Q15929 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
ZNF56Q15929 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
ZNF56Q15929 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
ZNF56Q15929 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
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ZNF56Q15929 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
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ZNF56Q15929 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
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ZNF56Q15929 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
ZNF56Q15929 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
ZNF56Q15929 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
ZNF56Q15929 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
ZNF56Q15929 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
ZNF56Q15929 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
ZNF56Q15929 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
ZNF56Q15929 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
ZNF56Q15929 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
ZNF56Q15929 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
ZNF56Q15929 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
ZNF56Q15929 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
ZNF56Q15929 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
ZNF56Q15929 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
ZNF56Q15929 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
ZNF56Q15929 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
ZNF56Q15929 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
ZNF56Q15929 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
ZNF56Q15929 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
ZNF56Q15929 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
ZNF56Q15929 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
ZNF56Q15929 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
ZNF56Q15929 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
ZNF56Q15929 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
ZNF56Q15929 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
ZNF56Q15929 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
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