Protein–RNA interactions for Protein: Q15399

TLR1, Toll-like receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 786 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLR1Q15399 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TLR1Q15399 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TLR1Q15399 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TLR1Q15399 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TLR1Q15399 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TLR1Q15399 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TLR1Q15399 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TLR1Q15399 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TLR1Q15399 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TLR1Q15399 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TLR1Q15399 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TLR1Q15399 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TLR1Q15399 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TLR1Q15399 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TLR1Q15399 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TLR1Q15399 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TLR1Q15399 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TLR1Q15399 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TLR1Q15399 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TLR1Q15399 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TLR1Q15399 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
TLR1Q15399 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
TLR1Q15399 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TLR1Q15399 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TLR1Q15399 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
TLR1Q15399 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TLR1Q15399 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TLR1Q15399 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TLR1Q15399 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TLR1Q15399 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TLR1Q15399 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TLR1Q15399 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TLR1Q15399 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TLR1Q15399 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TLR1Q15399 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TLR1Q15399 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TLR1Q15399 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
TLR1Q15399 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TLR1Q15399 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TLR1Q15399 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TLR1Q15399 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TLR1Q15399 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TLR1Q15399 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
TLR1Q15399 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TLR1Q15399 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TLR1Q15399 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TLR1Q15399 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TLR1Q15399 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TLR1Q15399 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TLR1Q15399 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
TLR1Q15399 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TLR1Q15399 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TLR1Q15399 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TLR1Q15399 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TLR1Q15399 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TLR1Q15399 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TLR1Q15399 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TLR1Q15399 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TLR1Q15399 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
TLR1Q15399 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TLR1Q15399 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TLR1Q15399 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TLR1Q15399 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TLR1Q15399 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TLR1Q15399 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TLR1Q15399 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TLR1Q15399 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TLR1Q15399 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TLR1Q15399 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TLR1Q15399 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TLR1Q15399 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TLR1Q15399 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TLR1Q15399 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
TLR1Q15399 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TLR1Q15399 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TLR1Q15399 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TLR1Q15399 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TLR1Q15399 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TLR1Q15399 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TLR1Q15399 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TLR1Q15399 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TLR1Q15399 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TLR1Q15399 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TLR1Q15399 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TLR1Q15399 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TLR1Q15399 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TLR1Q15399 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TLR1Q15399 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TLR1Q15399 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TLR1Q15399 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TLR1Q15399 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TLR1Q15399 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TLR1Q15399 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TLR1Q15399 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TLR1Q15399 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TLR1Q15399 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TLR1Q15399 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TLR1Q15399 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TLR1Q15399 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TLR1Q15399 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.4 ms