Protein–RNA interactions for Protein: Q15029

EFTUD2, 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 972 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2Q15029 SLC39A4-206ENST00000530807 498 ntTSL 215.47■□□□□ 0.071e-7■■■■■ 37.1
EFTUD2Q15029 SLC39A4-209ENST00000532718 668 ntTSL 1 (best)14.18□□□□□ -0.141e-7■■■■■ 37.1
EFTUD2Q15029 PRODH2-202ENST00000587695 1956 ntTSL 219.08■□□□□ 0.651e-20■■■■■ 37.1
EFTUD2Q15029 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.111e-20■■■■■ 37.1
EFTUD2Q15029 KMT5B-207ENST00000427752 2475 ntTSL 223.72■■□□□ 1.392e-17■■■■■ 37.1
EFTUD2Q15029 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.872e-17■■■■■ 37.1
EFTUD2Q15029 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.872e-17■■■■■ 37.1
EFTUD2Q15029 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.732e-17■■■■■ 37.1
EFTUD2Q15029 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.652e-17■■■■■ 37.1
EFTUD2Q15029 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.332e-17■■■■■ 37.1
EFTUD2Q15029 KMT5B-209ENST00000441488 2816 ntTSL 1 (best)9.37□□□□□ -0.912e-17■■■■■ 37.1
EFTUD2Q15029 KMT5B-215ENST00000615954 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.472e-17■■■■■ 37.1
EFTUD2Q15029 KMT5B-202ENST00000323599 653 ntTSL 35.74□□□□□ -1.492e-17■■■■■ 37.1
EFTUD2Q15029 HNRNPU-210ENST00000483966 1069 ntTSL 23.5□□□□□ -1.852e-7■■■■■ 37.1
EFTUD2Q15029 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.782e-6■■■■■ 37.1
EFTUD2Q15029 FLII-207ENST00000478416 878 ntTSL 213.32□□□□□ -0.281e-11■■■■■ 37.1
EFTUD2Q15029 FLII-229ENST00000584444 782 ntTSL 311.15□□□□□ -0.621e-11■■■■■ 37.1
EFTUD2Q15029 FLII-225ENST00000581349 582 ntTSL 210.09□□□□□ -0.791e-11■■■■■ 37.1
EFTUD2Q15029 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.662e-6■■■■■ 37.1
EFTUD2Q15029 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.312e-6■■■■■ 37.1
EFTUD2Q15029 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.112e-6■■■■■ 37.1
EFTUD2Q15029 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.032e-6■■■■■ 37.1
EFTUD2Q15029 KRI1-214ENST00000612875 2608 ntTSL 222.67■■□□□ 1.221e-6■■■■■ 37.1
EFTUD2Q15029 KRI1-203ENST00000478863 2545 ntTSL 219.77■□□□□ 0.761e-6■■■■■ 37.1
EFTUD2Q15029 KRI1-201ENST00000312962 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.281e-6■■■■■ 37.1
EFTUD2Q15029 KRI1-204ENST00000536689 3744 ntTSL 212.65□□□□□ -0.381e-6■■■■■ 37.1
EFTUD2Q15029 KRI1-209ENST00000539027 582 ntTSL 510.46□□□□□ -0.731e-6■■■■■ 37.1
EFTUD2Q15029 XPO1-221ENST00000489954 583 ntTSL 44.94□□□□□ -1.624e-19■■■■■ 37
EFTUD2Q15029 HDAC5-207ENST00000588261 846 ntTSL 314.49□□□□□ -0.097e-8■■■■■ 37
EFTUD2Q15029 DDX39A-214ENST00000590556 575 ntTSL 218.72■□□□□ 0.591e-6■■■■■ 37
EFTUD2Q15029 DDX39A-221ENST00000593026 657 ntTSL 314.54□□□□□ -0.087e-7■■■■■ 37
EFTUD2Q15029 MYBBP1A-201ENST00000254718 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.132e-7■■■■■ 37
EFTUD2Q15029 MYBBP1A-202ENST00000381556 4104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.582e-7■■■■■ 37
EFTUD2Q15029 MYBBP1A-207ENST00000573116 3795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)11.23□□□□□ -0.612e-7■■■■■ 37
EFTUD2Q15029 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.272e-7■■■■■ 37
EFTUD2Q15029 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.327e-7■■■■■ 37
EFTUD2Q15029 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.137e-7■■■■■ 37
EFTUD2Q15029 PEX10-206ENST00000510434 907 ntTSL 320.95■□□□□ 0.947e-7■■■■■ 37
EFTUD2Q15029 PEX10-207ENST00000514502 548 ntTSL 420.68■□□□□ 0.97e-7■■■■■ 37
EFTUD2Q15029 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.447e-7■■■■■ 37
EFTUD2Q15029 UQCRC1-204ENST00000460105 622 ntTSL 214.67□□□□□ -0.061e-6■■■■■ 37
EFTUD2Q15029 RELA-223ENST00000534283 575 ntTSL 522.54■■□□□ 1.23e-8■■■■■ 37
EFTUD2Q15029 RELA-224ENST00000534305 666 ntTSL 315.49■□□□□ 0.073e-8■■■■■ 37
EFTUD2Q15029 RELA-218ENST00000532776 602 ntTSL 214.92□□□□□ -0.023e-8■■■■■ 37
EFTUD2Q15029 RELA-206ENST00000525858 754 ntTSL 213.22□□□□□ -0.293e-8■■■■■ 37
EFTUD2Q15029 SLC2A4RG-206ENST00000491109 637 ntTSL 213.67□□□□□ -0.224e-14■■■■■ 37
EFTUD2Q15029 KIF2C-204ENST00000452259 1124 ntTSL 58.8□□□□□ -15e-8■■■■■ 37
EFTUD2Q15029 KIF2C-208ENST00000493027 1091 ntTSL 56.22□□□□□ -1.415e-8■■■■■ 37
EFTUD2Q15029 NARS-210ENST00000589314 1036 ntTSL 58.96□□□□□ -0.988e-8■■■■■ 37
EFTUD2Q15029 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.572e-6■■■■■ 37
EFTUD2Q15029 NAPRT-208ENST00000480946 1199 ntTSL 518.14■□□□□ 0.493e-7■■■■■ 37
EFTUD2Q15029 BAG6-257ENST00000462875 972 ntTSL 216.83■□□□□ 0.282e-12■■■■■ 37
EFTUD2Q15029 SLC43A3-209ENST00000528098 1260 ntTSL 214.34□□□□□ -0.112e-7■■■■■ 37
EFTUD2Q15029 MTG1-208ENST00000498790 693 ntTSL 216.57■□□□□ 0.244e-7■■■■■ 37
EFTUD2Q15029 COL7A1-210ENST00000487017 5807 ntTSL 517.38■□□□□ 0.378e-7■■■■■ 37
EFTUD2Q15029 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.248e-7■■■■■ 36.9
EFTUD2Q15029 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.188e-7■■■■■ 36.9
EFTUD2Q15029 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.058e-7■■■■■ 36.9
EFTUD2Q15029 LMNA-204ENST00000368298 1475 ntTSL 1 (best)18.11■□□□□ 0.493e-7■■■■■ 36.9
EFTUD2Q15029 ZGPAT-205ENST00000431125 427 ntTSL 218.08■□□□□ 0.481e-6■■■■■ 36.9
EFTUD2Q15029 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.131e-8■■■■■ 36.9
EFTUD2Q15029 SKA3-205ENST00000465471 930 ntTSL 519.68■□□□□ 0.741e-8■■■■■ 36.9
EFTUD2Q15029 CYB5R1-204ENST00000478009 899 ntTSL 219.07■□□□□ 0.641e-8■■■■■ 36.9
EFTUD2Q15029 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.641e-8■■■■■ 36.9
EFTUD2Q15029 CNPPD1-204ENST00000453038 1154 ntTSL 218.97■□□□□ 0.631e-8■■■■■ 36.9
EFTUD2Q15029 CNPPD1-203ENST00000451647 919 ntTSL 318.74■□□□□ 0.591e-8■■■■■ 36.9
EFTUD2Q15029 PSMD7-206ENST00000568717 1395 ntTSL 218.4■□□□□ 0.541e-8■■■■■ 36.9
EFTUD2Q15029 PSMD7-203ENST00000566015 537 ntTSL 217.65■□□□□ 0.421e-8■■■■■ 36.9
EFTUD2Q15029 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.411e-8■■■■■ 36.9
EFTUD2Q15029 RFWD3-203ENST00000571776 936 ntTSL 217.19■□□□□ 0.341e-8■■■■■ 36.9
EFTUD2Q15029 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.241e-8■■■■■ 36.9
EFTUD2Q15029 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.241e-8■■■■■ 36.9
EFTUD2Q15029 RFWD3-207ENST00000572990 599 ntTSL 416.07■□□□□ 0.161e-8■■■■■ 36.9
EFTUD2Q15029 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 01e-8■■■■■ 36.9
EFTUD2Q15029 ASH2L-201ENST00000343823 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.021e-8■■■■■ 36.9
EFTUD2Q15029 SKA3-204ENST00000462482 750 ntTSL 214.34□□□□□ -0.111e-8■■■■■ 36.9
EFTUD2Q15029 SKA3-201ENST00000298260 2803 ntTSL 214.3□□□□□ -0.121e-8■■■■■ 36.9
EFTUD2Q15029 SKA3-202ENST00000314759 2919 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.141e-8■■■■■ 36.9
EFTUD2Q15029 TDP2-205ENST00000480495 714 ntTSL 1 (best)14.13□□□□□ -0.151e-8■■■■■ 36.9
EFTUD2Q15029 ASH2L-203ENST00000517496 2194 ntTSL 213.85□□□□□ -0.191e-8■■■■■ 36.9
EFTUD2Q15029 ASH2L-206ENST00000520079 2119 ntTSL 212.67□□□□□ -0.381e-8■■■■■ 36.9
EFTUD2Q15029 PSMD7-205ENST00000568615 931 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.441e-8■■■■■ 36.9
EFTUD2Q15029 SKA3-203ENST00000400018 2745 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.51e-8■■■■■ 36.9
EFTUD2Q15029 TDP2-204ENST00000478507 573 ntTSL 511.8□□□□□ -0.521e-8■■■■■ 36.9
EFTUD2Q15029 SKA3-206ENST00000475251 397 ntTSL 211.66□□□□□ -0.541e-8■■■■■ 36.9
EFTUD2Q15029 ASH2L-208ENST00000521808 613 ntTSL 511.43□□□□□ -0.581e-8■■■■■ 36.9
EFTUD2Q15029 ASH2L-207ENST00000521652 2433 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.691e-8■■■■■ 36.9
EFTUD2Q15029 ASH2L-202ENST00000428278 2678 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.751e-8■■■■■ 36.9
EFTUD2Q15029 RFWD3-212ENST00000576652 528 ntTSL 49.73□□□□□ -0.851e-8■■■■■ 36.9
EFTUD2Q15029 RFWD3-211ENST00000575397 841 ntTSL 29.67□□□□□ -0.861e-8■■■■■ 36.9
EFTUD2Q15029 FAM219B-207ENST00000563706 582 ntTSL 48.84□□□□□ -0.991e-8■■■■■ 36.9
EFTUD2Q15029 POMT2-205ENST00000554564 725 ntTSL 38.31□□□□□ -1.081e-8■■■■■ 36.9
EFTUD2Q15029 RFWD3-206ENST00000572840 458 ntTSL 28.2□□□□□ -1.11e-8■■■■■ 36.9
EFTUD2Q15029 FAM219B-216ENST00000567388 449 ntTSL 56.64□□□□□ -1.351e-8■■■■■ 36.9
EFTUD2Q15029 CENPT-226ENST00000568069 507 ntTSL 418.8■□□□□ 0.66e-8■■■■■ 36.9
EFTUD2Q15029 CENPT-205ENST00000562462 1005 ntTSL 213.92□□□□□ -0.186e-8■■■■■ 36.9
EFTUD2Q15029 CENPT-221ENST00000565713 822 ntTSL 212.64□□□□□ -0.396e-8■■■■■ 36.9
EFTUD2Q15029 GLYR1-205ENST00000587297 688 ntTSL 210.06□□□□□ -0.82e-9■■■■■ 36.9
EFTUD2Q15029 GLYR1-203ENST00000586095 319 ntTSL 23.73□□□□□ -1.812e-9■■■■■ 36.9
EFTUD2Q15029 IPO4-204ENST00000558193 555 ntTSL 418.18■□□□□ 0.58e-7■■■■■ 36.9
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