Protein–RNA interactions for Protein: Q15011

HERPUD1, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 1 protein, humanhuman

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Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD1Q15011 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HERPUD1Q15011 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HERPUD1Q15011 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HERPUD1Q15011 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HERPUD1Q15011 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HERPUD1Q15011 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HERPUD1Q15011 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HERPUD1Q15011 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HERPUD1Q15011 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HERPUD1Q15011 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HERPUD1Q15011 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HERPUD1Q15011 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HERPUD1Q15011 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HERPUD1Q15011 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HERPUD1Q15011 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HERPUD1Q15011 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HERPUD1Q15011 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HERPUD1Q15011 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
HERPUD1Q15011 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HERPUD1Q15011 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HERPUD1Q15011 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HERPUD1Q15011 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HERPUD1Q15011 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HERPUD1Q15011 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HERPUD1Q15011 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HERPUD1Q15011 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HERPUD1Q15011 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HERPUD1Q15011 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HERPUD1Q15011 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HERPUD1Q15011 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HERPUD1Q15011 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HERPUD1Q15011 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HERPUD1Q15011 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HERPUD1Q15011 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HERPUD1Q15011 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HERPUD1Q15011 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HERPUD1Q15011 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HERPUD1Q15011 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HERPUD1Q15011 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HERPUD1Q15011 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HERPUD1Q15011 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HERPUD1Q15011 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HERPUD1Q15011 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HERPUD1Q15011 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HERPUD1Q15011 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
HERPUD1Q15011 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HERPUD1Q15011 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
HERPUD1Q15011 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HERPUD1Q15011 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HERPUD1Q15011 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HERPUD1Q15011 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HERPUD1Q15011 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HERPUD1Q15011 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HERPUD1Q15011 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HERPUD1Q15011 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HERPUD1Q15011 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HERPUD1Q15011 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HERPUD1Q15011 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HERPUD1Q15011 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HERPUD1Q15011 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
HERPUD1Q15011 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HERPUD1Q15011 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HERPUD1Q15011 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HERPUD1Q15011 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HERPUD1Q15011 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HERPUD1Q15011 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HERPUD1Q15011 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HERPUD1Q15011 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
HERPUD1Q15011 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HERPUD1Q15011 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HERPUD1Q15011 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HERPUD1Q15011 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HERPUD1Q15011 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HERPUD1Q15011 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HERPUD1Q15011 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HERPUD1Q15011 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HERPUD1Q15011 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HERPUD1Q15011 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HERPUD1Q15011 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HERPUD1Q15011 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HERPUD1Q15011 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HERPUD1Q15011 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HERPUD1Q15011 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
HERPUD1Q15011 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HERPUD1Q15011 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HERPUD1Q15011 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HERPUD1Q15011 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HERPUD1Q15011 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HERPUD1Q15011 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HERPUD1Q15011 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HERPUD1Q15011 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HERPUD1Q15011 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HERPUD1Q15011 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
HERPUD1Q15011 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HERPUD1Q15011 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HERPUD1Q15011 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HERPUD1Q15011 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HERPUD1Q15011 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HERPUD1Q15011 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HERPUD1Q15011 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
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