Protein–RNA interactions for Protein: Q15004

PCLAF, PCNA-associated factor, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCLAFQ15004 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PCLAFQ15004 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PCLAFQ15004 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PCLAFQ15004 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PCLAFQ15004 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PCLAFQ15004 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PCLAFQ15004 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PCLAFQ15004 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PCLAFQ15004 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PCLAFQ15004 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PCLAFQ15004 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PCLAFQ15004 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PCLAFQ15004 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PCLAFQ15004 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PCLAFQ15004 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PCLAFQ15004 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PCLAFQ15004 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PCLAFQ15004 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PCLAFQ15004 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
PCLAFQ15004 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PCLAFQ15004 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PCLAFQ15004 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PCLAFQ15004 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PCLAFQ15004 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PCLAFQ15004 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
PCLAFQ15004 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PCLAFQ15004 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PCLAFQ15004 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PCLAFQ15004 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PCLAFQ15004 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PCLAFQ15004 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
PCLAFQ15004 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PCLAFQ15004 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PCLAFQ15004 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
PCLAFQ15004 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PCLAFQ15004 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PCLAFQ15004 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
PCLAFQ15004 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PCLAFQ15004 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PCLAFQ15004 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PCLAFQ15004 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PCLAFQ15004 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PCLAFQ15004 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
PCLAFQ15004 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PCLAFQ15004 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PCLAFQ15004 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PCLAFQ15004 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PCLAFQ15004 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PCLAFQ15004 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PCLAFQ15004 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PCLAFQ15004 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PCLAFQ15004 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PCLAFQ15004 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PCLAFQ15004 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PCLAFQ15004 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PCLAFQ15004 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PCLAFQ15004 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PCLAFQ15004 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PCLAFQ15004 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PCLAFQ15004 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PCLAFQ15004 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PCLAFQ15004 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PCLAFQ15004 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PCLAFQ15004 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PCLAFQ15004 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PCLAFQ15004 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PCLAFQ15004 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PCLAFQ15004 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PCLAFQ15004 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PCLAFQ15004 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PCLAFQ15004 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PCLAFQ15004 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PCLAFQ15004 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PCLAFQ15004 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PCLAFQ15004 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PCLAFQ15004 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PCLAFQ15004 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PCLAFQ15004 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PCLAFQ15004 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PCLAFQ15004 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PCLAFQ15004 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PCLAFQ15004 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PCLAFQ15004 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PCLAFQ15004 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PCLAFQ15004 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PCLAFQ15004 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PCLAFQ15004 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PCLAFQ15004 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PCLAFQ15004 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
PCLAFQ15004 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PCLAFQ15004 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PCLAFQ15004 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PCLAFQ15004 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PCLAFQ15004 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
PCLAFQ15004 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PCLAFQ15004 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PCLAFQ15004 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PCLAFQ15004 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PCLAFQ15004 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PCLAFQ15004 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
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