Protein–RNA interactions for Protein: Q13310

PABPC4, Polyadenylate-binding protein 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC4Q13310 METTL7A-202ENST00000547104 1825 ntTSL 1 (best)14.66□□□□□ -0.062e-6■■■■□ 21.1
PABPC4Q13310 METTL7A-201ENST00000332160 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.782e-6■■■■□ 21.1
PABPC4Q13310 METTL7A-203ENST00000548553 4076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.892e-6■■■■□ 21.1
PABPC4Q13310 TMEM132D-AS1-205ENST00000540739 490 ntTSL 1 (best)5.26□□□□□ -1.572e-14■■■■□ 21.1
PABPC4Q13310 RPL26-203ENST00000578115 569 ntTSL 25.48□□□□□ -1.538e-28■■■■□ 21.1
PABPC4Q13310 SLC4A2-208ENST00000469467 442 ntTSL 212.39□□□□□ -0.433e-7■■■■□ 21.1
PABPC4Q13310 USP10-202ENST00000540269 3070 ntTSL 1 (best)13.73□□□□□ -0.213e-13■■■■□ 21.1
PABPC4Q13310 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.425e-13■■■■□ 21
PABPC4Q13310 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.541e-323■■■■□ 21
PABPC4Q13310 YBX1-203ENST00000436427 1524 ntTSL 1 (best)24.56■■□□□ 1.521e-323■■■■□ 21
PABPC4Q13310 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.654e-12■■■■□ 21
PABPC4Q13310 PPP2R5C-203ENST00000350249 3845 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.272e-7■■■■□ 21
PABPC4Q13310 SLC2A3-209ENST00000543435 383 ntTSL 311.95□□□□□ -0.56e-12■■■■□ 21
PABPC4Q13310 SLC2A3-201ENST00000075120 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.916e-12■■■■□ 21
PABPC4Q13310 SLC2A3-205ENST00000486749 4414 ntTSL 1 (best)9.32□□□□□ -0.926e-12■■■■□ 21
PABPC4Q13310 GUK1-220ENST00000471270 657 ntTSL 226.84■■□□□ 1.895e-7■■■■□ 21
PABPC4Q13310 GUK1-224ENST00000480056 544 ntTSL 320.42■□□□□ 0.865e-7■■■■□ 21
PABPC4Q13310 AC134978.1-201ENST00000579480 788 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.414e-33■■■■□ 21
PABPC4Q13310 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.084e-8■■■■□ 21
PABPC4Q13310 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.364e-8■■■■□ 21
PABPC4Q13310 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.334e-8■■■■□ 21
PABPC4Q13310 NAXE-204ENST00000467374 779 ntTSL 213.84□□□□□ -0.193e-7■■■■□ 21
PABPC4Q13310 FKBP8-208ENST00000597611 966 ntTSL 318.54■□□□□ 0.561e-7■■■■□ 21
PABPC4Q13310 CNIH1-202ENST00000395573 1233 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.251e-6■■■■□ 21
PABPC4Q13310 CNIH1-201ENST00000216416 4793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.221e-6■■■■□ 21
PABPC4Q13310 RPS6KB2-209ENST00000528964 1806 ntTSL 522.5■■□□□ 1.192e-6■■■■□ 21
PABPC4Q13310 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.162e-6■■■■□ 21
PABPC4Q13310 RPS6KB2-205ENST00000525088 5528 ntTSL 215.54■□□□□ 0.082e-6■■■■□ 21
PABPC4Q13310 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.453e-7■■■■□ 21
PABPC4Q13310 KDM5C-208ENST00000452825 6096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.053e-7■■■■□ 21
PABPC4Q13310 FIS1-208ENST00000480497 530 ntTSL 320.65■□□□□ 0.93e-8■■■■□ 21
PABPC4Q13310 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.922e-7■■■■□ 21
PABPC4Q13310 ETV4-202ENST00000393664 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.152e-7■■■■□ 21
PABPC4Q13310 ETV4-203ENST00000538265 2147 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.132e-7■■■■□ 21
PABPC4Q13310 ARHGEF1-205ENST00000593609 576 ntTSL 221.99■■□□□ 1.112e-7■■■■□ 21
PABPC4Q13310 AHSP-203ENST00000569954 391 ntTSL 511.91□□□□□ -0.58e-8■■■■□ 21
PABPC4Q13310 AHSP-201ENST00000302312 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.848e-8■■■■□ 21
PABPC4Q13310 DCXR-205ENST00000577996 98 ntTSL 3-1.21□□□□□ -2.61e-12■■■■□ 21
PABPC4Q13310 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.511e-17■■■■□ 20.9
PABPC4Q13310 PTMS-203ENST00000538057 976 ntTSL 224.36■■□□□ 1.491e-17■■■■□ 20.9
PABPC4Q13310 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.131e-17■■■■□ 20.9
PABPC4Q13310 PTMS-204ENST00000540667 820 ntTSL 217■□□□□ 0.311e-17■■■■□ 20.9
PABPC4Q13310 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.433e-8■■■■□ 20.9
PABPC4Q13310 CISD1-204ENST00000489785 577 ntTSL 27.75□□□□□ -1.173e-8■■■■□ 20.9
PABPC4Q13310 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.813e-7■■■■□ 20.9
PABPC4Q13310 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.511e-6■■■■□ 20.9
PABPC4Q13310 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.181e-6■■■■□ 20.9
PABPC4Q13310 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.171e-6■■■■□ 20.9
PABPC4Q13310 NDUFV1-209ENST00000527355 679 ntTSL 217.94■□□□□ 0.467e-11■■■■□ 20.9
PABPC4Q13310 HRAS-207ENST00000468682 749 ntTSL 323.59■■□□□ 1.376e-8■■■■□ 20.9
PABPC4Q13310 ARF5-204ENST00000463733 1509 ntTSL 521.44■■□□□ 1.022e-9■■■■□ 20.9
PABPC4Q13310 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.382e-9■■■■□ 20.9
PABPC4Q13310 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.534e-8■■■■□ 20.9
PABPC4Q13310 AC008763.2-201ENST00000598664 537 ntAPPRIS P5 TSL 518.67■□□□□ 0.586e-7■■■■□ 20.9
PABPC4Q13310 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.514e-8■■■■□ 20.9
PABPC4Q13310 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.722e-7■■■■□ 20.9
PABPC4Q13310 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 13e-8■■■■□ 20.9
PABPC4Q13310 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.743e-8■■■■□ 20.9
PABPC4Q13310 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.643e-8■■■■□ 20.9
PABPC4Q13310 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.513e-8■■■■□ 20.9
PABPC4Q13310 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.453e-8■■■■□ 20.9
PABPC4Q13310 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.343e-8■■■■□ 20.9
PABPC4Q13310 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.273e-8■■■■□ 20.9
PABPC4Q13310 CCNG1-203ENST00000504553 732 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.411e-10■■■■□ 20.9
PABPC4Q13310 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.027e-9■■■■□ 20.9
PABPC4Q13310 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.36e-6■■■■□ 20.9
PABPC4Q13310 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.198e-9■■■■□ 20.9
PABPC4Q13310 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.178e-9■■■■□ 20.9
PABPC4Q13310 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.082e-16■■■■□ 20.9
PABPC4Q13310 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.078e-9■■■■□ 20.9
PABPC4Q13310 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.026e-10■■■■□ 20.9
PABPC4Q13310 MAN1B1-216ENST00000550113 774 ntTSL 321.09■□□□□ 0.978e-9■■■■□ 20.9
PABPC4Q13310 PLXND1-202ENST00000501038 1633 ntTSL 1 (best)20.65■□□□□ 0.96e-10■■■■□ 20.9
PABPC4Q13310 PLXND1-204ENST00000504524 1701 ntTSL 1 (best)20.5■□□□□ 0.876e-10■■■■□ 20.9
PABPC4Q13310 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.821e-12■■■■□ 20.9
PABPC4Q13310 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.788e-9■■■■□ 20.9
PABPC4Q13310 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.756e-6■■■■□ 20.9
PABPC4Q13310 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.718e-9■■■■□ 20.9
PABPC4Q13310 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.626e-6■■■■□ 20.9
PABPC4Q13310 MAN1B1-204ENST00000475449 905 ntTSL 318.9■□□□□ 0.628e-9■■■■□ 20.9
PABPC4Q13310 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.618e-9■■■■□ 20.9
PABPC4Q13310 TBC1D17-203ENST00000594984 1441 ntTSL 518.58■□□□□ 0.573e-6■■■■□ 20.9
PABPC4Q13310 PLXND1-214ENST00000512744 2662 ntTSL 1 (best)18.29■□□□□ 0.526e-10■■■■□ 20.9
PABPC4Q13310 KDM2B-216ENST00000543025 2522 ntTSL 1 (best)18.13■□□□□ 0.491e-12■■■■□ 20.9
PABPC4Q13310 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.486e-10■■■■□ 20.9
PABPC4Q13310 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.448e-9■■■■□ 20.9
PABPC4Q13310 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.43e-6■■■■□ 20.9
PABPC4Q13310 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.32e-16■■■■□ 20.9
PABPC4Q13310 PMM1-205ENST00000472620 1576 ntTSL 516.81■□□□□ 0.288e-9■■■■□ 20.9
PABPC4Q13310 PMM1-208ENST00000485648 1405 ntTSL 516.43■□□□□ 0.228e-9■■■■□ 20.9
PABPC4Q13310 SNHG15-205ENST00000580458 710 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.222e-16■■■■□ 20.9
PABPC4Q13310 MAN1B1-203ENST00000474902 2336 ntTSL 216.33■□□□□ 0.28e-9■■■■□ 20.9
PABPC4Q13310 PMM1-203ENST00000463617 2538 ntTSL 216.06■□□□□ 0.168e-9■■■■□ 20.9
PABPC4Q13310 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.158e-9■■■■□ 20.9
PABPC4Q13310 MAN1B1-209ENST00000536349 5048 ntTSL 216.01■□□□□ 0.158e-9■■■■□ 20.9
PABPC4Q13310 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.158e-9■■■■□ 20.9
PABPC4Q13310 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.153e-6■■■■□ 20.9
PABPC4Q13310 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.153e-6■■■■□ 20.9
PABPC4Q13310 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.151e-12■■■■□ 20.9
PABPC4Q13310 PCGF2-201ENST00000610747 459 ntTSL 215.92■□□□□ 0.148e-9■■■■□ 20.9
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