Protein–RNA interactions for Protein: Q13216

ERCC8, DNA excision repair protein ERCC-8, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC8Q13216 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ERCC8Q13216 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ERCC8Q13216 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ERCC8Q13216 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ERCC8Q13216 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
ERCC8Q13216 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
ERCC8Q13216 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
ERCC8Q13216 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
ERCC8Q13216 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
ERCC8Q13216 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
ERCC8Q13216 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
ERCC8Q13216 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
ERCC8Q13216 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.04
ERCC8Q13216 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
ERCC8Q13216 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
ERCC8Q13216 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
ERCC8Q13216 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
ERCC8Q13216 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
ERCC8Q13216 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
ERCC8Q13216 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
ERCC8Q13216 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
ERCC8Q13216 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC14.77□□□□□ -0.05
ERCC8Q13216 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC14.77□□□□□ -0.05
ERCC8Q13216 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
ERCC8Q13216 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC14.77□□□□□ -0.05
ERCC8Q13216 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
ERCC8Q13216 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
ERCC8Q13216 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
ERCC8Q13216 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ERCC8Q13216 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ERCC8Q13216 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ERCC8Q13216 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ERCC8Q13216 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ERCC8Q13216 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ERCC8Q13216 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ERCC8Q13216 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ERCC8Q13216 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
ERCC8Q13216 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ERCC8Q13216 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ERCC8Q13216 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ERCC8Q13216 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ERCC8Q13216 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ERCC8Q13216 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ERCC8Q13216 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ERCC8Q13216 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ERCC8Q13216 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ERCC8Q13216 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ERCC8Q13216 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ERCC8Q13216 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ERCC8Q13216 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ERCC8Q13216 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ERCC8Q13216 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ERCC8Q13216 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ERCC8Q13216 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ERCC8Q13216 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ERCC8Q13216 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ERCC8Q13216 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ERCC8Q13216 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ERCC8Q13216 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ERCC8Q13216 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ERCC8Q13216 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
ERCC8Q13216 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ERCC8Q13216 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
ERCC8Q13216 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ERCC8Q13216 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ERCC8Q13216 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ERCC8Q13216 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ERCC8Q13216 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ERCC8Q13216 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ERCC8Q13216 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ERCC8Q13216 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ERCC8Q13216 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ERCC8Q13216 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ERCC8Q13216 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ERCC8Q13216 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ERCC8Q13216 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ERCC8Q13216 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ERCC8Q13216 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ERCC8Q13216 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ERCC8Q13216 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ERCC8Q13216 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ERCC8Q13216 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ERCC8Q13216 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ERCC8Q13216 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ERCC8Q13216 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ERCC8Q13216 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ERCC8Q13216 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ERCC8Q13216 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ERCC8Q13216 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ERCC8Q13216 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ERCC8Q13216 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ERCC8Q13216 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ERCC8Q13216 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ERCC8Q13216 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
ERCC8Q13216 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ERCC8Q13216 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ERCC8Q13216 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ERCC8Q13216 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ERCC8Q13216 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ERCC8Q13216 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms