Protein–RNA interactions for Protein: Q12791

KCNMA1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,236 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMA1Q12791 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
KCNMA1Q12791 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
KCNMA1Q12791 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
KCNMA1Q12791 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
KCNMA1Q12791 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
KCNMA1Q12791 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
KCNMA1Q12791 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
KCNMA1Q12791 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KCNMA1Q12791 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KCNMA1Q12791 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KCNMA1Q12791 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
KCNMA1Q12791 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
KCNMA1Q12791 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KCNMA1Q12791 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
KCNMA1Q12791 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
KCNMA1Q12791 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
KCNMA1Q12791 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
KCNMA1Q12791 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
KCNMA1Q12791 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
KCNMA1Q12791 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
KCNMA1Q12791 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
KCNMA1Q12791 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
KCNMA1Q12791 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KCNMA1Q12791 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
KCNMA1Q12791 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
KCNMA1Q12791 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
KCNMA1Q12791 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KCNMA1Q12791 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KCNMA1Q12791 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
KCNMA1Q12791 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
KCNMA1Q12791 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
KCNMA1Q12791 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
KCNMA1Q12791 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
KCNMA1Q12791 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
KCNMA1Q12791 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
KCNMA1Q12791 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
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KCNMA1Q12791 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
KCNMA1Q12791 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
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KCNMA1Q12791 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
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KCNMA1Q12791 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
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KCNMA1Q12791 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
KCNMA1Q12791 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
KCNMA1Q12791 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
KCNMA1Q12791 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
KCNMA1Q12791 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
KCNMA1Q12791 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
KCNMA1Q12791 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
KCNMA1Q12791 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
KCNMA1Q12791 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
KCNMA1Q12791 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
KCNMA1Q12791 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
KCNMA1Q12791 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
KCNMA1Q12791 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
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KCNMA1Q12791 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
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KCNMA1Q12791 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
KCNMA1Q12791 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KCNMA1Q12791 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
KCNMA1Q12791 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KCNMA1Q12791 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
KCNMA1Q12791 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KCNMA1Q12791 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
KCNMA1Q12791 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
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KCNMA1Q12791 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
KCNMA1Q12791 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
KCNMA1Q12791 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
KCNMA1Q12791 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
KCNMA1Q12791 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
KCNMA1Q12791 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KCNMA1Q12791 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KCNMA1Q12791 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KCNMA1Q12791 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KCNMA1Q12791 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KCNMA1Q12791 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KCNMA1Q12791 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
KCNMA1Q12791 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
KCNMA1Q12791 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
KCNMA1Q12791 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
KCNMA1Q12791 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
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