Protein–RNA interactions for Protein: Q08170

SRSF4, Serine/arginine-rich splicing factor 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF4Q08170 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SRSF4Q08170 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SRSF4Q08170 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SRSF4Q08170 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SRSF4Q08170 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SRSF4Q08170 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SRSF4Q08170 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SRSF4Q08170 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SRSF4Q08170 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SRSF4Q08170 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SRSF4Q08170 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SRSF4Q08170 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SRSF4Q08170 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SRSF4Q08170 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SRSF4Q08170 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SRSF4Q08170 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SRSF4Q08170 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SRSF4Q08170 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SRSF4Q08170 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SRSF4Q08170 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SRSF4Q08170 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SRSF4Q08170 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SRSF4Q08170 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SRSF4Q08170 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SRSF4Q08170 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SRSF4Q08170 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SRSF4Q08170 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SRSF4Q08170 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SRSF4Q08170 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SRSF4Q08170 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SRSF4Q08170 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SRSF4Q08170 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SRSF4Q08170 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SRSF4Q08170 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SRSF4Q08170 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SRSF4Q08170 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SRSF4Q08170 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SRSF4Q08170 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SRSF4Q08170 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SRSF4Q08170 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SRSF4Q08170 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SRSF4Q08170 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SRSF4Q08170 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SRSF4Q08170 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SRSF4Q08170 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SRSF4Q08170 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SRSF4Q08170 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SRSF4Q08170 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SRSF4Q08170 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SRSF4Q08170 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SRSF4Q08170 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SRSF4Q08170 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SRSF4Q08170 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SRSF4Q08170 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SRSF4Q08170 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SRSF4Q08170 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SRSF4Q08170 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SRSF4Q08170 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SRSF4Q08170 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SRSF4Q08170 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SRSF4Q08170 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SRSF4Q08170 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SRSF4Q08170 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SRSF4Q08170 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SRSF4Q08170 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SRSF4Q08170 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SRSF4Q08170 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SRSF4Q08170 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SRSF4Q08170 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SRSF4Q08170 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SRSF4Q08170 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SRSF4Q08170 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SRSF4Q08170 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SRSF4Q08170 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SRSF4Q08170 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SRSF4Q08170 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SRSF4Q08170 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SRSF4Q08170 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SRSF4Q08170 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SRSF4Q08170 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SRSF4Q08170 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SRSF4Q08170 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SRSF4Q08170 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SRSF4Q08170 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SRSF4Q08170 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SRSF4Q08170 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SRSF4Q08170 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SRSF4Q08170 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SRSF4Q08170 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SRSF4Q08170 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SRSF4Q08170 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SRSF4Q08170 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SRSF4Q08170 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SRSF4Q08170 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SRSF4Q08170 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SRSF4Q08170 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SRSF4Q08170 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SRSF4Q08170 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SRSF4Q08170 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SRSF4Q08170 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms