Protein–RNA interactions for Protein: Q03721

KCNC4, Potassium voltage-gated channel subfamily C member 4, humanhuman

Predictions only

Length 635 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNC4Q03721 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
KCNC4Q03721 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
KCNC4Q03721 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
KCNC4Q03721 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
KCNC4Q03721 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
KCNC4Q03721 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
KCNC4Q03721 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
KCNC4Q03721 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
KCNC4Q03721 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KCNC4Q03721 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KCNC4Q03721 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
KCNC4Q03721 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
KCNC4Q03721 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KCNC4Q03721 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KCNC4Q03721 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
KCNC4Q03721 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
KCNC4Q03721 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KCNC4Q03721 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
KCNC4Q03721 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KCNC4Q03721 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KCNC4Q03721 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
KCNC4Q03721 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
KCNC4Q03721 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
KCNC4Q03721 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
KCNC4Q03721 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
KCNC4Q03721 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
KCNC4Q03721 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
KCNC4Q03721 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
KCNC4Q03721 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KCNC4Q03721 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KCNC4Q03721 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KCNC4Q03721 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KCNC4Q03721 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KCNC4Q03721 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KCNC4Q03721 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
KCNC4Q03721 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
KCNC4Q03721 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
KCNC4Q03721 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
KCNC4Q03721 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KCNC4Q03721 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KCNC4Q03721 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KCNC4Q03721 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KCNC4Q03721 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KCNC4Q03721 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
KCNC4Q03721 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
KCNC4Q03721 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KCNC4Q03721 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KCNC4Q03721 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
KCNC4Q03721 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
KCNC4Q03721 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
KCNC4Q03721 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
KCNC4Q03721 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
KCNC4Q03721 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
KCNC4Q03721 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
KCNC4Q03721 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KCNC4Q03721 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
KCNC4Q03721 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KCNC4Q03721 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
KCNC4Q03721 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
KCNC4Q03721 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KCNC4Q03721 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KCNC4Q03721 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KCNC4Q03721 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KCNC4Q03721 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KCNC4Q03721 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
KCNC4Q03721 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
KCNC4Q03721 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KCNC4Q03721 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
KCNC4Q03721 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KCNC4Q03721 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KCNC4Q03721 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KCNC4Q03721 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
KCNC4Q03721 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
KCNC4Q03721 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
KCNC4Q03721 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
KCNC4Q03721 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KCNC4Q03721 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
KCNC4Q03721 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KCNC4Q03721 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KCNC4Q03721 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KCNC4Q03721 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KCNC4Q03721 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
KCNC4Q03721 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
KCNC4Q03721 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
KCNC4Q03721 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
KCNC4Q03721 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
KCNC4Q03721 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
KCNC4Q03721 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
KCNC4Q03721 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
KCNC4Q03721 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
KCNC4Q03721 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
KCNC4Q03721 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
KCNC4Q03721 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
KCNC4Q03721 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
KCNC4Q03721 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
KCNC4Q03721 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
KCNC4Q03721 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
KCNC4Q03721 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
KCNC4Q03721 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
KCNC4Q03721 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms