Protein–RNA interactions for Protein: Q00604

NDP, Norrin, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDPQ00604 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NDPQ00604 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NDPQ00604 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NDPQ00604 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
NDPQ00604 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NDPQ00604 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NDPQ00604 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NDPQ00604 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NDPQ00604 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NDPQ00604 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NDPQ00604 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NDPQ00604 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NDPQ00604 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NDPQ00604 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NDPQ00604 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NDPQ00604 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NDPQ00604 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NDPQ00604 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
NDPQ00604 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NDPQ00604 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NDPQ00604 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NDPQ00604 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NDPQ00604 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NDPQ00604 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NDPQ00604 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NDPQ00604 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NDPQ00604 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
NDPQ00604 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NDPQ00604 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
NDPQ00604 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
NDPQ00604 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
NDPQ00604 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NDPQ00604 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NDPQ00604 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NDPQ00604 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NDPQ00604 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NDPQ00604 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NDPQ00604 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NDPQ00604 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NDPQ00604 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NDPQ00604 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NDPQ00604 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NDPQ00604 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NDPQ00604 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NDPQ00604 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NDPQ00604 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NDPQ00604 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NDPQ00604 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NDPQ00604 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NDPQ00604 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NDPQ00604 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NDPQ00604 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NDPQ00604 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NDPQ00604 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NDPQ00604 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NDPQ00604 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NDPQ00604 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NDPQ00604 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NDPQ00604 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NDPQ00604 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NDPQ00604 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NDPQ00604 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NDPQ00604 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NDPQ00604 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NDPQ00604 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NDPQ00604 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NDPQ00604 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NDPQ00604 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NDPQ00604 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NDPQ00604 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NDPQ00604 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NDPQ00604 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NDPQ00604 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NDPQ00604 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NDPQ00604 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NDPQ00604 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NDPQ00604 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NDPQ00604 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NDPQ00604 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NDPQ00604 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NDPQ00604 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NDPQ00604 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NDPQ00604 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NDPQ00604 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NDPQ00604 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NDPQ00604 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NDPQ00604 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
NDPQ00604 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NDPQ00604 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NDPQ00604 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NDPQ00604 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NDPQ00604 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NDPQ00604 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NDPQ00604 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NDPQ00604 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NDPQ00604 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NDPQ00604 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NDPQ00604 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NDPQ00604 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
NDPQ00604 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms