Protein–RNA interactions for Protein: Q00597

FANCC, Fanconi anemia group C protein, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCCQ00597 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FANCCQ00597 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FANCCQ00597 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FANCCQ00597 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FANCCQ00597 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FANCCQ00597 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FANCCQ00597 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FANCCQ00597 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
FANCCQ00597 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
FANCCQ00597 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FANCCQ00597 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
FANCCQ00597 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
FANCCQ00597 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FANCCQ00597 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FANCCQ00597 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FANCCQ00597 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FANCCQ00597 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
FANCCQ00597 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
FANCCQ00597 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
FANCCQ00597 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
FANCCQ00597 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
FANCCQ00597 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FANCCQ00597 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FANCCQ00597 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
FANCCQ00597 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
FANCCQ00597 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
FANCCQ00597 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
FANCCQ00597 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
FANCCQ00597 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
FANCCQ00597 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FANCCQ00597 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FANCCQ00597 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FANCCQ00597 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FANCCQ00597 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FANCCQ00597 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FANCCQ00597 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FANCCQ00597 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FANCCQ00597 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FANCCQ00597 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FANCCQ00597 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FANCCQ00597 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FANCCQ00597 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FANCCQ00597 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FANCCQ00597 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FANCCQ00597 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FANCCQ00597 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FANCCQ00597 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FANCCQ00597 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FANCCQ00597 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FANCCQ00597 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FANCCQ00597 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FANCCQ00597 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FANCCQ00597 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FANCCQ00597 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FANCCQ00597 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FANCCQ00597 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FANCCQ00597 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FANCCQ00597 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FANCCQ00597 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FANCCQ00597 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FANCCQ00597 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FANCCQ00597 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FANCCQ00597 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FANCCQ00597 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FANCCQ00597 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FANCCQ00597 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FANCCQ00597 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FANCCQ00597 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FANCCQ00597 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FANCCQ00597 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FANCCQ00597 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FANCCQ00597 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FANCCQ00597 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FANCCQ00597 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
FANCCQ00597 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FANCCQ00597 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FANCCQ00597 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FANCCQ00597 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FANCCQ00597 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
FANCCQ00597 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FANCCQ00597 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FANCCQ00597 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FANCCQ00597 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FANCCQ00597 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
FANCCQ00597 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FANCCQ00597 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FANCCQ00597 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FANCCQ00597 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FANCCQ00597 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FANCCQ00597 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FANCCQ00597 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FANCCQ00597 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FANCCQ00597 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FANCCQ00597 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FANCCQ00597 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FANCCQ00597 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FANCCQ00597 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FANCCQ00597 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FANCCQ00597 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FANCCQ00597 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms