Protein–RNA interactions for Protein: Q00534

CDK6, Cyclin-dependent kinase 6, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK6Q00534 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDK6Q00534 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDK6Q00534 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDK6Q00534 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDK6Q00534 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDK6Q00534 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDK6Q00534 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDK6Q00534 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDK6Q00534 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDK6Q00534 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDK6Q00534 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDK6Q00534 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDK6Q00534 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDK6Q00534 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDK6Q00534 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDK6Q00534 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDK6Q00534 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDK6Q00534 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDK6Q00534 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CDK6Q00534 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDK6Q00534 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDK6Q00534 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDK6Q00534 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDK6Q00534 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDK6Q00534 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDK6Q00534 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDK6Q00534 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDK6Q00534 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDK6Q00534 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDK6Q00534 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDK6Q00534 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDK6Q00534 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDK6Q00534 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDK6Q00534 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDK6Q00534 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDK6Q00534 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDK6Q00534 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDK6Q00534 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDK6Q00534 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDK6Q00534 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDK6Q00534 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDK6Q00534 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDK6Q00534 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDK6Q00534 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDK6Q00534 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDK6Q00534 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDK6Q00534 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDK6Q00534 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDK6Q00534 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDK6Q00534 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDK6Q00534 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CDK6Q00534 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDK6Q00534 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDK6Q00534 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDK6Q00534 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDK6Q00534 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDK6Q00534 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDK6Q00534 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDK6Q00534 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDK6Q00534 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDK6Q00534 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDK6Q00534 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDK6Q00534 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDK6Q00534 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDK6Q00534 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDK6Q00534 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDK6Q00534 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDK6Q00534 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDK6Q00534 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDK6Q00534 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CDK6Q00534 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CDK6Q00534 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CDK6Q00534 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CDK6Q00534 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CDK6Q00534 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CDK6Q00534 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CDK6Q00534 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CDK6Q00534 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CDK6Q00534 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CDK6Q00534 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CDK6Q00534 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CDK6Q00534 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CDK6Q00534 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CDK6Q00534 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CDK6Q00534 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
CDK6Q00534 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDK6Q00534 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDK6Q00534 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDK6Q00534 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDK6Q00534 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDK6Q00534 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDK6Q00534 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDK6Q00534 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDK6Q00534 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDK6Q00534 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDK6Q00534 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDK6Q00534 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDK6Q00534 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDK6Q00534 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDK6Q00534 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms