Protein–RNA interactions for Protein: P55773

CCL23, C-C motif chemokine 23, humanhuman

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL23P55773 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCL23P55773 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCL23P55773 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCL23P55773 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCL23P55773 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCL23P55773 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCL23P55773 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CCL23P55773 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCL23P55773 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCL23P55773 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCL23P55773 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCL23P55773 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCL23P55773 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CCL23P55773 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCL23P55773 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CCL23P55773 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCL23P55773 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCL23P55773 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CCL23P55773 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCL23P55773 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCL23P55773 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCL23P55773 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCL23P55773 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCL23P55773 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCL23P55773 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCL23P55773 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCL23P55773 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCL23P55773 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCL23P55773 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCL23P55773 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCL23P55773 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCL23P55773 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCL23P55773 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCL23P55773 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCL23P55773 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCL23P55773 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCL23P55773 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCL23P55773 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCL23P55773 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCL23P55773 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CCL23P55773 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCL23P55773 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCL23P55773 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCL23P55773 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCL23P55773 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCL23P55773 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCL23P55773 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CCL23P55773 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCL23P55773 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCL23P55773 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCL23P55773 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCL23P55773 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCL23P55773 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCL23P55773 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCL23P55773 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCL23P55773 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCL23P55773 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CCL23P55773 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCL23P55773 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCL23P55773 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCL23P55773 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCL23P55773 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCL23P55773 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CCL23P55773 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CCL23P55773 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCL23P55773 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCL23P55773 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCL23P55773 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCL23P55773 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCL23P55773 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCL23P55773 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CCL23P55773 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCL23P55773 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCL23P55773 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCL23P55773 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCL23P55773 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCL23P55773 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCL23P55773 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCL23P55773 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCL23P55773 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCL23P55773 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCL23P55773 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCL23P55773 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCL23P55773 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCL23P55773 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCL23P55773 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CCL23P55773 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCL23P55773 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCL23P55773 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCL23P55773 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCL23P55773 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCL23P55773 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCL23P55773 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCL23P55773 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCL23P55773 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCL23P55773 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCL23P55773 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CCL23P55773 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CCL23P55773 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCL23P55773 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms