Protein–RNA interactions for Protein: P55212

CASP6, Caspase-6, humanhuman

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP6P55212 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CASP6P55212 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CASP6P55212 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CASP6P55212 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CASP6P55212 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CASP6P55212 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CASP6P55212 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CASP6P55212 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CASP6P55212 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CASP6P55212 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CASP6P55212 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CASP6P55212 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CASP6P55212 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CASP6P55212 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CASP6P55212 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CASP6P55212 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CASP6P55212 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CASP6P55212 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CASP6P55212 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CASP6P55212 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CASP6P55212 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CASP6P55212 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CASP6P55212 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
CASP6P55212 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CASP6P55212 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CASP6P55212 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CASP6P55212 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CASP6P55212 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CASP6P55212 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CASP6P55212 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CASP6P55212 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CASP6P55212 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CASP6P55212 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CASP6P55212 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CASP6P55212 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CASP6P55212 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CASP6P55212 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CASP6P55212 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CASP6P55212 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CASP6P55212 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CASP6P55212 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CASP6P55212 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CASP6P55212 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CASP6P55212 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CASP6P55212 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CASP6P55212 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CASP6P55212 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CASP6P55212 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CASP6P55212 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CASP6P55212 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CASP6P55212 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CASP6P55212 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CASP6P55212 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CASP6P55212 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CASP6P55212 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CASP6P55212 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CASP6P55212 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CASP6P55212 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CASP6P55212 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CASP6P55212 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CASP6P55212 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CASP6P55212 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CASP6P55212 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CASP6P55212 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CASP6P55212 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CASP6P55212 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CASP6P55212 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CASP6P55212 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CASP6P55212 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CASP6P55212 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CASP6P55212 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CASP6P55212 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CASP6P55212 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CASP6P55212 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CASP6P55212 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
CASP6P55212 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CASP6P55212 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
CASP6P55212 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CASP6P55212 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CASP6P55212 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CASP6P55212 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CASP6P55212 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CASP6P55212 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CASP6P55212 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CASP6P55212 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CASP6P55212 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CASP6P55212 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CASP6P55212 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
CASP6P55212 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CASP6P55212 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CASP6P55212 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CASP6P55212 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CASP6P55212 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CASP6P55212 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CASP6P55212 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CASP6P55212 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CASP6P55212 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CASP6P55212 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CASP6P55212 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CASP6P55212 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms