Protein–RNA interactions for Protein: P47211

GALR1, Galanin receptor type 1, humanhuman

Predictions only

Length 349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GALR1P47211 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GALR1P47211 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GALR1P47211 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GALR1P47211 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GALR1P47211 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GALR1P47211 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GALR1P47211 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GALR1P47211 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GALR1P47211 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GALR1P47211 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GALR1P47211 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GALR1P47211 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GALR1P47211 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GALR1P47211 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GALR1P47211 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GALR1P47211 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GALR1P47211 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GALR1P47211 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GALR1P47211 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GALR1P47211 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GALR1P47211 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GALR1P47211 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GALR1P47211 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
GALR1P47211 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
GALR1P47211 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GALR1P47211 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GALR1P47211 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GALR1P47211 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GALR1P47211 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GALR1P47211 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GALR1P47211 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GALR1P47211 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GALR1P47211 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GALR1P47211 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GALR1P47211 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GALR1P47211 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GALR1P47211 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GALR1P47211 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GALR1P47211 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GALR1P47211 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GALR1P47211 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GALR1P47211 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GALR1P47211 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GALR1P47211 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GALR1P47211 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GALR1P47211 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GALR1P47211 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GALR1P47211 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GALR1P47211 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
GALR1P47211 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GALR1P47211 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GALR1P47211 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
GALR1P47211 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GALR1P47211 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GALR1P47211 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GALR1P47211 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
GALR1P47211 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GALR1P47211 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GALR1P47211 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GALR1P47211 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GALR1P47211 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GALR1P47211 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GALR1P47211 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GALR1P47211 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GALR1P47211 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GALR1P47211 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GALR1P47211 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GALR1P47211 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GALR1P47211 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GALR1P47211 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GALR1P47211 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
GALR1P47211 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GALR1P47211 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GALR1P47211 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GALR1P47211 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GALR1P47211 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GALR1P47211 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GALR1P47211 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GALR1P47211 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GALR1P47211 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GALR1P47211 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GALR1P47211 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GALR1P47211 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GALR1P47211 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GALR1P47211 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GALR1P47211 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GALR1P47211 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GALR1P47211 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GALR1P47211 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GALR1P47211 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GALR1P47211 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
GALR1P47211 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
GALR1P47211 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GALR1P47211 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GALR1P47211 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GALR1P47211 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GALR1P47211 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GALR1P47211 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GALR1P47211 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GALR1P47211 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms