Protein–RNA interactions for Protein: P43694

GATA4, Transcription factor GATA-4, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATA4P43694 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GATA4P43694 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GATA4P43694 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GATA4P43694 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GATA4P43694 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GATA4P43694 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GATA4P43694 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GATA4P43694 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GATA4P43694 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GATA4P43694 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
GATA4P43694 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
GATA4P43694 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GATA4P43694 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GATA4P43694 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GATA4P43694 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GATA4P43694 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GATA4P43694 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GATA4P43694 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GATA4P43694 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GATA4P43694 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GATA4P43694 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GATA4P43694 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GATA4P43694 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GATA4P43694 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GATA4P43694 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GATA4P43694 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GATA4P43694 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GATA4P43694 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GATA4P43694 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GATA4P43694 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GATA4P43694 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GATA4P43694 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GATA4P43694 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GATA4P43694 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GATA4P43694 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GATA4P43694 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GATA4P43694 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GATA4P43694 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GATA4P43694 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GATA4P43694 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GATA4P43694 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GATA4P43694 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GATA4P43694 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GATA4P43694 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GATA4P43694 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GATA4P43694 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GATA4P43694 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GATA4P43694 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GATA4P43694 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GATA4P43694 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GATA4P43694 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GATA4P43694 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GATA4P43694 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GATA4P43694 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
GATA4P43694 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GATA4P43694 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GATA4P43694 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GATA4P43694 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GATA4P43694 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GATA4P43694 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GATA4P43694 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GATA4P43694 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GATA4P43694 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GATA4P43694 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GATA4P43694 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GATA4P43694 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GATA4P43694 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GATA4P43694 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GATA4P43694 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GATA4P43694 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GATA4P43694 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GATA4P43694 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GATA4P43694 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GATA4P43694 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GATA4P43694 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GATA4P43694 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
GATA4P43694 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GATA4P43694 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GATA4P43694 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GATA4P43694 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GATA4P43694 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GATA4P43694 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GATA4P43694 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GATA4P43694 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
GATA4P43694 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
GATA4P43694 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
GATA4P43694 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GATA4P43694 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GATA4P43694 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GATA4P43694 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GATA4P43694 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GATA4P43694 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GATA4P43694 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GATA4P43694 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GATA4P43694 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GATA4P43694 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
GATA4P43694 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GATA4P43694 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GATA4P43694 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GATA4P43694 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms