Protein–RNA interactions for Protein: P36543

ATP6V1E1, V-type proton ATPase subunit E 1, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6V1E1P36543 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATP6V1E1P36543 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATP6V1E1P36543 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATP6V1E1P36543 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATP6V1E1P36543 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATP6V1E1P36543 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATP6V1E1P36543 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATP6V1E1P36543 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATP6V1E1P36543 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATP6V1E1P36543 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATP6V1E1P36543 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATP6V1E1P36543 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATP6V1E1P36543 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATP6V1E1P36543 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATP6V1E1P36543 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATP6V1E1P36543 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ATP6V1E1P36543 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATP6V1E1P36543 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATP6V1E1P36543 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATP6V1E1P36543 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATP6V1E1P36543 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATP6V1E1P36543 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATP6V1E1P36543 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATP6V1E1P36543 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATP6V1E1P36543 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP6V1E1P36543 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP6V1E1P36543 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP6V1E1P36543 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP6V1E1P36543 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP6V1E1P36543 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP6V1E1P36543 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP6V1E1P36543 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP6V1E1P36543 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP6V1E1P36543 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP6V1E1P36543 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP6V1E1P36543 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP6V1E1P36543 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP6V1E1P36543 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP6V1E1P36543 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP6V1E1P36543 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP6V1E1P36543 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP6V1E1P36543 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP6V1E1P36543 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP6V1E1P36543 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP6V1E1P36543 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP6V1E1P36543 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP6V1E1P36543 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP6V1E1P36543 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP6V1E1P36543 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP6V1E1P36543 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP6V1E1P36543 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP6V1E1P36543 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP6V1E1P36543 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP6V1E1P36543 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP6V1E1P36543 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP6V1E1P36543 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP6V1E1P36543 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP6V1E1P36543 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP6V1E1P36543 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP6V1E1P36543 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP6V1E1P36543 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP6V1E1P36543 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP6V1E1P36543 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP6V1E1P36543 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP6V1E1P36543 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP6V1E1P36543 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP6V1E1P36543 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP6V1E1P36543 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP6V1E1P36543 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP6V1E1P36543 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP6V1E1P36543 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP6V1E1P36543 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP6V1E1P36543 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP6V1E1P36543 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP6V1E1P36543 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP6V1E1P36543 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP6V1E1P36543 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP6V1E1P36543 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP6V1E1P36543 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP6V1E1P36543 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP6V1E1P36543 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP6V1E1P36543 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP6V1E1P36543 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP6V1E1P36543 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP6V1E1P36543 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP6V1E1P36543 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP6V1E1P36543 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP6V1E1P36543 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP6V1E1P36543 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP6V1E1P36543 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP6V1E1P36543 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP6V1E1P36543 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP6V1E1P36543 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP6V1E1P36543 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP6V1E1P36543 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATP6V1E1P36543 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATP6V1E1P36543 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATP6V1E1P36543 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATP6V1E1P36543 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATP6V1E1P36543 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms