Protein–RNA interactions for Protein: P20941

PDC, Phosducin, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCP20941 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PDCP20941 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDCP20941 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDCP20941 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDCP20941 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PDCP20941 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDCP20941 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PDCP20941 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDCP20941 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDCP20941 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDCP20941 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDCP20941 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDCP20941 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDCP20941 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDCP20941 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDCP20941 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDCP20941 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDCP20941 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDCP20941 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDCP20941 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDCP20941 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PDCP20941 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PDCP20941 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDCP20941 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDCP20941 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDCP20941 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDCP20941 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDCP20941 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDCP20941 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDCP20941 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDCP20941 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
PDCP20941 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
PDCP20941 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDCP20941 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDCP20941 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDCP20941 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDCP20941 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDCP20941 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDCP20941 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDCP20941 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDCP20941 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDCP20941 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDCP20941 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDCP20941 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDCP20941 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDCP20941 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDCP20941 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDCP20941 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDCP20941 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDCP20941 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PDCP20941 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDCP20941 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDCP20941 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDCP20941 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDCP20941 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDCP20941 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDCP20941 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDCP20941 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDCP20941 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDCP20941 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDCP20941 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDCP20941 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDCP20941 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PDCP20941 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDCP20941 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDCP20941 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDCP20941 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDCP20941 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDCP20941 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDCP20941 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDCP20941 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDCP20941 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDCP20941 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDCP20941 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDCP20941 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDCP20941 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDCP20941 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDCP20941 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PDCP20941 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDCP20941 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDCP20941 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PDCP20941 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDCP20941 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDCP20941 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDCP20941 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PDCP20941 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDCP20941 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDCP20941 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDCP20941 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDCP20941 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDCP20941 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDCP20941 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDCP20941 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDCP20941 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDCP20941 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDCP20941 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDCP20941 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDCP20941 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDCP20941 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PDCP20941 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms