Protein–RNA interactions for Protein: P13010

XRCC5, X-ray repair cross-complementing protein 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC5P13010 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
XRCC5P13010 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
XRCC5P13010 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
XRCC5P13010 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
XRCC5P13010 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
XRCC5P13010 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
XRCC5P13010 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
XRCC5P13010 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
XRCC5P13010 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
XRCC5P13010 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
XRCC5P13010 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
XRCC5P13010 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
XRCC5P13010 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
XRCC5P13010 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
XRCC5P13010 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
XRCC5P13010 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
XRCC5P13010 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
XRCC5P13010 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
XRCC5P13010 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
XRCC5P13010 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
XRCC5P13010 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
XRCC5P13010 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
XRCC5P13010 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
XRCC5P13010 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
XRCC5P13010 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
XRCC5P13010 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
XRCC5P13010 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
XRCC5P13010 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
XRCC5P13010 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
XRCC5P13010 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
XRCC5P13010 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
XRCC5P13010 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
XRCC5P13010 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
XRCC5P13010 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
XRCC5P13010 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
XRCC5P13010 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
XRCC5P13010 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
XRCC5P13010 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
XRCC5P13010 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
XRCC5P13010 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
XRCC5P13010 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
XRCC5P13010 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
XRCC5P13010 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
XRCC5P13010 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
XRCC5P13010 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
XRCC5P13010 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
XRCC5P13010 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
XRCC5P13010 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
XRCC5P13010 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
XRCC5P13010 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
XRCC5P13010 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
XRCC5P13010 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
XRCC5P13010 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
XRCC5P13010 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
XRCC5P13010 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
XRCC5P13010 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
XRCC5P13010 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
XRCC5P13010 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
XRCC5P13010 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
XRCC5P13010 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
XRCC5P13010 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
XRCC5P13010 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
XRCC5P13010 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
XRCC5P13010 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
XRCC5P13010 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
XRCC5P13010 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
XRCC5P13010 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
XRCC5P13010 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
XRCC5P13010 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
XRCC5P13010 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
XRCC5P13010 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
XRCC5P13010 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
XRCC5P13010 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
XRCC5P13010 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
XRCC5P13010 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
XRCC5P13010 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
XRCC5P13010 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
XRCC5P13010 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
XRCC5P13010 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
XRCC5P13010 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
XRCC5P13010 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
XRCC5P13010 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
XRCC5P13010 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
XRCC5P13010 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
XRCC5P13010 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
XRCC5P13010 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
XRCC5P13010 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
XRCC5P13010 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
XRCC5P13010 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
XRCC5P13010 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
XRCC5P13010 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
XRCC5P13010 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
XRCC5P13010 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
XRCC5P13010 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
XRCC5P13010 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
XRCC5P13010 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
XRCC5P13010 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
XRCC5P13010 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
XRCC5P13010 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
XRCC5P13010 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms