Protein–RNA interactions for Protein: P12838

DEFA4, Neutrophil defensin 4, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA4P12838 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DEFA4P12838 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DEFA4P12838 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DEFA4P12838 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DEFA4P12838 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DEFA4P12838 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DEFA4P12838 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DEFA4P12838 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DEFA4P12838 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DEFA4P12838 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DEFA4P12838 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DEFA4P12838 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DEFA4P12838 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DEFA4P12838 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DEFA4P12838 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DEFA4P12838 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DEFA4P12838 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DEFA4P12838 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DEFA4P12838 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DEFA4P12838 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DEFA4P12838 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DEFA4P12838 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DEFA4P12838 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DEFA4P12838 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DEFA4P12838 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DEFA4P12838 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
DEFA4P12838 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DEFA4P12838 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DEFA4P12838 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
DEFA4P12838 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DEFA4P12838 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DEFA4P12838 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DEFA4P12838 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
DEFA4P12838 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
DEFA4P12838 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DEFA4P12838 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DEFA4P12838 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DEFA4P12838 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DEFA4P12838 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DEFA4P12838 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DEFA4P12838 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DEFA4P12838 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DEFA4P12838 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DEFA4P12838 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DEFA4P12838 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DEFA4P12838 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DEFA4P12838 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DEFA4P12838 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DEFA4P12838 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DEFA4P12838 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
DEFA4P12838 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DEFA4P12838 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DEFA4P12838 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DEFA4P12838 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DEFA4P12838 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DEFA4P12838 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DEFA4P12838 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
DEFA4P12838 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
DEFA4P12838 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DEFA4P12838 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DEFA4P12838 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DEFA4P12838 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DEFA4P12838 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DEFA4P12838 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DEFA4P12838 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DEFA4P12838 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DEFA4P12838 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DEFA4P12838 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DEFA4P12838 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DEFA4P12838 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
DEFA4P12838 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DEFA4P12838 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DEFA4P12838 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DEFA4P12838 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DEFA4P12838 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DEFA4P12838 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DEFA4P12838 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DEFA4P12838 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DEFA4P12838 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DEFA4P12838 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DEFA4P12838 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DEFA4P12838 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DEFA4P12838 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DEFA4P12838 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DEFA4P12838 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DEFA4P12838 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DEFA4P12838 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DEFA4P12838 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DEFA4P12838 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DEFA4P12838 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DEFA4P12838 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DEFA4P12838 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
DEFA4P12838 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DEFA4P12838 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DEFA4P12838 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DEFA4P12838 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DEFA4P12838 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DEFA4P12838 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DEFA4P12838 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DEFA4P12838 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.4 ms