Protein–RNA interactions for Protein: O15254

ACOX3, Peroxisomal acyl-coenzyme A oxidase 3, humanhuman

Predictions only

Length 700 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACOX3O15254 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACOX3O15254 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACOX3O15254 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACOX3O15254 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACOX3O15254 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACOX3O15254 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACOX3O15254 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
ACOX3O15254 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
ACOX3O15254 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
ACOX3O15254 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACOX3O15254 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACOX3O15254 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACOX3O15254 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACOX3O15254 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACOX3O15254 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACOX3O15254 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACOX3O15254 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACOX3O15254 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACOX3O15254 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACOX3O15254 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACOX3O15254 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACOX3O15254 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACOX3O15254 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACOX3O15254 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACOX3O15254 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACOX3O15254 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACOX3O15254 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACOX3O15254 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACOX3O15254 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ACOX3O15254 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
ACOX3O15254 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ACOX3O15254 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ACOX3O15254 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ACOX3O15254 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ACOX3O15254 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ACOX3O15254 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ACOX3O15254 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ACOX3O15254 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ACOX3O15254 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
ACOX3O15254 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ACOX3O15254 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ACOX3O15254 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ACOX3O15254 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
ACOX3O15254 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ACOX3O15254 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ACOX3O15254 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ACOX3O15254 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ACOX3O15254 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ACOX3O15254 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ACOX3O15254 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ACOX3O15254 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ACOX3O15254 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ACOX3O15254 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ACOX3O15254 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ACOX3O15254 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ACOX3O15254 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
ACOX3O15254 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
ACOX3O15254 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ACOX3O15254 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ACOX3O15254 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ACOX3O15254 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ACOX3O15254 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ACOX3O15254 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ACOX3O15254 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ACOX3O15254 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ACOX3O15254 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ACOX3O15254 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ACOX3O15254 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ACOX3O15254 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ACOX3O15254 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ACOX3O15254 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ACOX3O15254 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ACOX3O15254 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ACOX3O15254 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ACOX3O15254 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ACOX3O15254 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ACOX3O15254 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ACOX3O15254 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ACOX3O15254 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ACOX3O15254 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
ACOX3O15254 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ACOX3O15254 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ACOX3O15254 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ACOX3O15254 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ACOX3O15254 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ACOX3O15254 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ACOX3O15254 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ACOX3O15254 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ACOX3O15254 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ACOX3O15254 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ACOX3O15254 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ACOX3O15254 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ACOX3O15254 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ACOX3O15254 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ACOX3O15254 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ACOX3O15254 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ACOX3O15254 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ACOX3O15254 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ACOX3O15254 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ACOX3O15254 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms