Protein–RNA interactions for Protein: B4DEV8

Proteasome subunit alpha type, humanhuman

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DEV8 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
B4DEV8 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
B4DEV8 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
B4DEV8 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
B4DEV8 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
B4DEV8 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
B4DEV8 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
B4DEV8 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
B4DEV8 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
B4DEV8 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
B4DEV8 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
B4DEV8 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
B4DEV8 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
B4DEV8 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
B4DEV8 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
B4DEV8 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
B4DEV8 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
B4DEV8 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
B4DEV8 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
B4DEV8 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
B4DEV8 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
B4DEV8 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
B4DEV8 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
B4DEV8 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
B4DEV8 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
B4DEV8 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
B4DEV8 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
B4DEV8 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
B4DEV8 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
B4DEV8 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
B4DEV8 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
B4DEV8 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
B4DEV8 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
B4DEV8 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
B4DEV8 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
B4DEV8 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
B4DEV8 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
B4DEV8 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
B4DEV8 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
B4DEV8 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
B4DEV8 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
B4DEV8 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
B4DEV8 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
B4DEV8 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
B4DEV8 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
B4DEV8 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
B4DEV8 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
B4DEV8 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
B4DEV8 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
B4DEV8 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
B4DEV8 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
B4DEV8 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
B4DEV8 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
B4DEV8 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
B4DEV8 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
B4DEV8 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
B4DEV8 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
B4DEV8 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
B4DEV8 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
B4DEV8 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
B4DEV8 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
B4DEV8 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
B4DEV8 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
B4DEV8 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
B4DEV8 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
B4DEV8 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
B4DEV8 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
B4DEV8 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
B4DEV8 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
B4DEV8 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
B4DEV8 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
B4DEV8 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
B4DEV8 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
B4DEV8 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
B4DEV8 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
B4DEV8 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
B4DEV8 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
B4DEV8 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
B4DEV8 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
B4DEV8 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
B4DEV8 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
B4DEV8 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
B4DEV8 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
B4DEV8 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
B4DEV8 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
B4DEV8 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
B4DEV8 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
B4DEV8 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
B4DEV8 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
B4DEV8 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
B4DEV8 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
B4DEV8 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
B4DEV8 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
B4DEV8 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
B4DEV8 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
B4DEV8 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
B4DEV8 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
B4DEV8 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
B4DEV8 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
B4DEV8 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms