Protein–RNA interactions for Protein: B2RUZ4

SMIM1, Small integral membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM1B2RUZ4 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SMIM1B2RUZ4 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SMIM1B2RUZ4 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SMIM1B2RUZ4 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SMIM1B2RUZ4 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SMIM1B2RUZ4 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SMIM1B2RUZ4 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SMIM1B2RUZ4 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SMIM1B2RUZ4 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SMIM1B2RUZ4 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SMIM1B2RUZ4 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SMIM1B2RUZ4 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SMIM1B2RUZ4 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SMIM1B2RUZ4 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SMIM1B2RUZ4 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SMIM1B2RUZ4 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SMIM1B2RUZ4 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SMIM1B2RUZ4 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SMIM1B2RUZ4 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SMIM1B2RUZ4 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SMIM1B2RUZ4 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SMIM1B2RUZ4 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SMIM1B2RUZ4 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SMIM1B2RUZ4 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SMIM1B2RUZ4 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SMIM1B2RUZ4 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SMIM1B2RUZ4 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SMIM1B2RUZ4 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SMIM1B2RUZ4 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SMIM1B2RUZ4 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SMIM1B2RUZ4 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SMIM1B2RUZ4 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
SMIM1B2RUZ4 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
SMIM1B2RUZ4 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SMIM1B2RUZ4 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SMIM1B2RUZ4 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
SMIM1B2RUZ4 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SMIM1B2RUZ4 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SMIM1B2RUZ4 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SMIM1B2RUZ4 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SMIM1B2RUZ4 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SMIM1B2RUZ4 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SMIM1B2RUZ4 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SMIM1B2RUZ4 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SMIM1B2RUZ4 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SMIM1B2RUZ4 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SMIM1B2RUZ4 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SMIM1B2RUZ4 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SMIM1B2RUZ4 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SMIM1B2RUZ4 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SMIM1B2RUZ4 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SMIM1B2RUZ4 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SMIM1B2RUZ4 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SMIM1B2RUZ4 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SMIM1B2RUZ4 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
SMIM1B2RUZ4 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
SMIM1B2RUZ4 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SMIM1B2RUZ4 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
SMIM1B2RUZ4 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SMIM1B2RUZ4 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SMIM1B2RUZ4 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
SMIM1B2RUZ4 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SMIM1B2RUZ4 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SMIM1B2RUZ4 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SMIM1B2RUZ4 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SMIM1B2RUZ4 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SMIM1B2RUZ4 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SMIM1B2RUZ4 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SMIM1B2RUZ4 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SMIM1B2RUZ4 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SMIM1B2RUZ4 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SMIM1B2RUZ4 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SMIM1B2RUZ4 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SMIM1B2RUZ4 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SMIM1B2RUZ4 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SMIM1B2RUZ4 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SMIM1B2RUZ4 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SMIM1B2RUZ4 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SMIM1B2RUZ4 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SMIM1B2RUZ4 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SMIM1B2RUZ4 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SMIM1B2RUZ4 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SMIM1B2RUZ4 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SMIM1B2RUZ4 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SMIM1B2RUZ4 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SMIM1B2RUZ4 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SMIM1B2RUZ4 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SMIM1B2RUZ4 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SMIM1B2RUZ4 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SMIM1B2RUZ4 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SMIM1B2RUZ4 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SMIM1B2RUZ4 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SMIM1B2RUZ4 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SMIM1B2RUZ4 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
SMIM1B2RUZ4 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SMIM1B2RUZ4 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SMIM1B2RUZ4 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SMIM1B2RUZ4 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SMIM1B2RUZ4 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SMIM1B2RUZ4 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms