Protein–RNA interactions for Protein: A0A0K0K1B3

TRBV30, T-cell receptor beta variable 30 (gene/pseudogene) (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV30A0A0K0K1B3 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
TRBV30A0A0K0K1B3 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
TRBV30A0A0K0K1B3 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
TRBV30A0A0K0K1B3 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
TRBV30A0A0K0K1B3 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
TRBV30A0A0K0K1B3 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
TRBV30A0A0K0K1B3 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
TRBV30A0A0K0K1B3 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
TRBV30A0A0K0K1B3 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
TRBV30A0A0K0K1B3 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
TRBV30A0A0K0K1B3 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
TRBV30A0A0K0K1B3 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
TRBV30A0A0K0K1B3 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
TRBV30A0A0K0K1B3 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
TRBV30A0A0K0K1B3 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
TRBV30A0A0K0K1B3 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TRBV30A0A0K0K1B3 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TRBV30A0A0K0K1B3 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
TRBV30A0A0K0K1B3 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
TRBV30A0A0K0K1B3 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TRBV30A0A0K0K1B3 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TRBV30A0A0K0K1B3 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TRBV30A0A0K0K1B3 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
TRBV30A0A0K0K1B3 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TRBV30A0A0K0K1B3 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TRBV30A0A0K0K1B3 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TRBV30A0A0K0K1B3 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
TRBV30A0A0K0K1B3 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TRBV30A0A0K0K1B3 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
TRBV30A0A0K0K1B3 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
TRBV30A0A0K0K1B3 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
TRBV30A0A0K0K1B3 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
TRBV30A0A0K0K1B3 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TRBV30A0A0K0K1B3 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC13.3□□□□□ -0.28
TRBV30A0A0K0K1B3 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
TRBV30A0A0K0K1B3 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC13.3□□□□□ -0.28
TRBV30A0A0K0K1B3 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
TRBV30A0A0K0K1B3 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TRBV30A0A0K0K1B3 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TRBV30A0A0K0K1B3 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
TRBV30A0A0K0K1B3 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TRBV30A0A0K0K1B3 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TRBV30A0A0K0K1B3 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
TRBV30A0A0K0K1B3 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TRBV30A0A0K0K1B3 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
TRBV30A0A0K0K1B3 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TRBV30A0A0K0K1B3 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TRBV30A0A0K0K1B3 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TRBV30A0A0K0K1B3 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TRBV30A0A0K0K1B3 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
TRBV30A0A0K0K1B3 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
TRBV30A0A0K0K1B3 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
TRBV30A0A0K0K1B3 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
TRBV30A0A0K0K1B3 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TRBV30A0A0K0K1B3 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TRBV30A0A0K0K1B3 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TRBV30A0A0K0K1B3 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
TRBV30A0A0K0K1B3 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
TRBV30A0A0K0K1B3 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
TRBV30A0A0K0K1B3 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TRBV30A0A0K0K1B3 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
TRBV30A0A0K0K1B3 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TRBV30A0A0K0K1B3 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
TRBV30A0A0K0K1B3 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
TRBV30A0A0K0K1B3 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
TRBV30A0A0K0K1B3 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TRBV30A0A0K0K1B3 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TRBV30A0A0K0K1B3 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TRBV30A0A0K0K1B3 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
TRBV30A0A0K0K1B3 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
TRBV30A0A0K0K1B3 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TRBV30A0A0K0K1B3 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TRBV30A0A0K0K1B3 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TRBV30A0A0K0K1B3 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
TRBV30A0A0K0K1B3 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TRBV30A0A0K0K1B3 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
TRBV30A0A0K0K1B3 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TRBV30A0A0K0K1B3 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
TRBV30A0A0K0K1B3 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TRBV30A0A0K0K1B3 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TRBV30A0A0K0K1B3 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
TRBV30A0A0K0K1B3 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
TRBV30A0A0K0K1B3 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TRBV30A0A0K0K1B3 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TRBV30A0A0K0K1B3 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
TRBV30A0A0K0K1B3 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
TRBV30A0A0K0K1B3 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
TRBV30A0A0K0K1B3 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
TRBV30A0A0K0K1B3 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TRBV30A0A0K0K1B3 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TRBV30A0A0K0K1B3 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
TRBV30A0A0K0K1B3 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
TRBV30A0A0K0K1B3 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TRBV30A0A0K0K1B3 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TRBV30A0A0K0K1B3 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TRBV30A0A0K0K1B3 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
TRBV30A0A0K0K1B3 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TRBV30A0A0K0K1B3 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TRBV30A0A0K0K1B3 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
TRBV30A0A0K0K1B3 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms