Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ66

KRTAP4-12, Keratin-associated protein 4-12, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP4-12Q9BQ66 LINC00607-204ENST00000423530 2104 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 TICAM1-201ENST00000248244 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 AC093627.7-201ENST00000567533 3208 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 ERGIC3-202ENST00000348547 1359 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 PSMB8-201ENST00000374881 1351 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 LINC00484-205ENST00000423719 3023 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 IL11RA-208ENST00000555003 3008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 SUCO-201ENST00000263688 5556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 GRAMD4-202ENST00000406902 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 EPC1-203ENST00000375110 3909 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF705D-202ENST00000400085 3377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 DIDO1-205ENST00000370371 2833 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 PKP1-203ENST00000367324 5384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 MBP-205ENST00000397860 4844 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 MYO1C-218ENST00000575158 4804 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 LBR-201ENST00000272163 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 DMBT1P1-203ENST00000636837 4628 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 LIN54-203ENST00000446851 4083 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 G3BP2-201ENST00000357854 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 CDHR3-211ENST00000478080 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 SYK-201ENST00000375746 4990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 FIGNL1-211ENST00000611938 3543 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 COL8A2-201ENST00000303143 4447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 DCAF4L2-201ENST00000319675 3326 ntAPPRIS P1 BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 ARHGAP11A-207ENST00000565905 3318 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 CHST4-201ENST00000338482 2412 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 KY-205ENST00000508956 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 CAND2-204ENST00000456430 4573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 NAA40-202ENST00000377793 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 MTA3-202ENST00000405592 5832 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 CHST6-201ENST00000332272 7957 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 KIAA0513-201ENST00000258180 7404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 C2orf88-201ENST00000340623 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 TMPRSS6-203ENST00000406725 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 MTFR1L-210ENST00000474295 1873 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 C4BPA-201ENST00000367070 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF331-203ENST00000449416 3817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 PLCB3-201ENST00000279230 4197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 SLC22A12-202ENST00000377567 2599 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 DDX12P-201ENST00000432996 2947 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 DGKB-205ENST00000406247 3257 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 KIAA0556-201ENST00000261588 6616 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 AR-201ENST00000374690 10652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 CIITA-213ENST00000618327 4657 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 TARDBP-201ENST00000240185 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 EIF3CL-201ENST00000380876 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 EIF3CL-202ENST00000398944 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 SLC4A9-201ENST00000432095 3086 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 SDC2-201ENST00000302190 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 G2E3-212ENST00000553504 3796 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 PASK-203ENST00000403638 5161 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 GABRG3-208ENST00000615808 10768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 MMAA-201ENST00000281317 7068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 NUP58-206ENST00000463407 6360 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 SPIN3-201ENST00000374919 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 SYTL2-201ENST00000316356 4293 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 AAMP-204ENST00000444053 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 PSMD12-201ENST00000356126 4406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 MAPK12-203ENST00000395780 1459 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 NFKB1-201ENST00000226574 4085 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 GRM8-201ENST00000339582 4057 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 TRPM8-204ENST00000433712 5291 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 SNX16-202ENST00000353788 3032 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 AP005435.3-201ENST00000531260 3198 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 TRIB2-201ENST00000155926 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 OR2B11-202ENST00000641149 6414 ntAPPRIS P1 BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 NUP93-220ENST00000569842 2834 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 SHOC2-201ENST00000265277 3691 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 TBC1D23-201ENST00000344949 3656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 RAPGEF6-207ENST00000507093 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 EBLN3P-202ENST00000625445 4520 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114.6 ms