Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ2

USP34, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 34, humanhuman

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Length 3,546 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP34Q70CQ2 IGFN1-202ENST00000335211 11810 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
USP34Q70CQ2 RNF20-202ENST00000389120 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
USP34Q70CQ2 PATE4-201ENST00000457514 1983 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
USP34Q70CQ2 CDKL4-201ENST00000378803 1567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
USP34Q70CQ2 SAMMSON-226ENST00000642089 1582 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
USP34Q70CQ2 DOCK5-201ENST00000276440 10075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
USP34Q70CQ2 S100A9-201ENST00000368738 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
USP34Q70CQ2 RNA5SP317-201ENST00000410176 116 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
USP34Q70CQ2 RNA5SP311-201ENST00000411290 116 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
USP34Q70CQ2 AL136368.1-201ENST00000416249 401 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
USP34Q70CQ2 AC097173.1-201ENST00000505862 819 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
USP34Q70CQ2 LINC00500-201ENST00000515860 539 ntTSL 4 BASIC5.07□□□□□ -1.6
USP34Q70CQ2 RNA5SP315-201ENST00000516340 116 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
USP34Q70CQ2 RNA5SP312-201ENST00000517068 116 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
USP34Q70CQ2 MRE11-209ENST00000540013 1212 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
USP34Q70CQ2 AL163952.1-202ENST00000569625 600 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
USP34Q70CQ2 SNX18P1Y-201ENST00000616231 511 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
USP34Q70CQ2 ZNF107-206ENST00000620827 5685 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC5.07□□□□□ -1.6
USP34Q70CQ2 AL033384.1-202ENST00000431554 3104 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
USP34Q70CQ2 LUZP2-208ENST00000620308 4981 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
USP34Q70CQ2 SLC26A7-208ENST00000523719 2902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
USP34Q70CQ2 DDX1-208ENST00000621973 2183 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
USP34Q70CQ2 NBPF9-205ENST00000613595 4527 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
USP34Q70CQ2 NCOA7-208ENST00000438495 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
USP34Q70CQ2 PCA3-201ENST00000412654 3922 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
USP34Q70CQ2 EP400-205ENST00000389562 12836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
USP34Q70CQ2 AL591719.2-201ENST00000437400 386 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
USP34Q70CQ2 AC010326.1-201ENST00000462726 602 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
USP34Q70CQ2 TRBV5-2-201ENST00000489095 273 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
USP34Q70CQ2 MIR3939-201ENST00000582614 106 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
USP34Q70CQ2 AC008814.1-201ENST00000603797 406 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
USP34Q70CQ2 AP005131.7-201ENST00000610087 611 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
USP34Q70CQ2 AL121890.2-201ENST00000617644 465 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
USP34Q70CQ2 TRANK1-201ENST00000429976 10481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
USP34Q70CQ2 MRPL35-202ENST00000337109 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
USP34Q70CQ2 NCAM1-222ENST00000615285 6045 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
USP34Q70CQ2 LARP1B-201ENST00000326639 4891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
USP34Q70CQ2 RFC1-202ENST00000381897 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
USP34Q70CQ2 MAPK10-338ENST00000641647 3362 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
USP34Q70CQ2 PPARA-201ENST00000262735 9965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
USP34Q70CQ2 OR2J3-202ENST00000641151 3297 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
USP34Q70CQ2 IL1RL1-201ENST00000233954 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
USP34Q70CQ2 MRPS23-201ENST00000313608 5621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
USP34Q70CQ2 LRBA-209ENST00000510413 10032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
USP34Q70CQ2 UGT2A3-201ENST00000251566 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
USP34Q70CQ2 ATP5A1P1-201ENST00000454088 1321 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
USP34Q70CQ2 RPL12P43-201ENST00000420608 499 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
USP34Q70CQ2 YWHABP1-201ENST00000445359 727 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
USP34Q70CQ2 AP001999.2-201ENST00000529417 389 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
USP34Q70CQ2 AC005191.1-201ENST00000603950 358 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
USP34Q70CQ2 AL591034.3-201ENST00000605511 685 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
USP34Q70CQ2 CLHC1-203ENST00000406076 1777 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
USP34Q70CQ2 AL031320.2-201ENST00000591892 2079 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
USP34Q70CQ2 DCP2-208ENST00000515408 8029 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
USP34Q70CQ2 CENPI-201ENST00000372926 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
USP34Q70CQ2 CASC15-203ENST00000605917 4461 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
USP34Q70CQ2 GABRQ-201ENST00000598523 6172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
USP34Q70CQ2 TRPM7-207ENST00000560955 7218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
USP34Q70CQ2 CHD2-202ENST00000420239 2221 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
USP34Q70CQ2 TNFAIP8-206ENST00000504771 8681 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
USP34Q70CQ2 IQGAP2-204ENST00000502745 3404 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
USP34Q70CQ2 ITGAV-204ENST00000433736 3288 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
USP34Q70CQ2 ERC1-202ENST00000355446 5796 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
USP34Q70CQ2 ABLIM1-206ENST00000392952 6841 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
USP34Q70CQ2 RNA5-8SP5-201ENST00000365304 152 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
USP34Q70CQ2 TEX35-205ENST00000367643 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
USP34Q70CQ2 CYCSP19-201ENST00000411715 316 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
USP34Q70CQ2 AL451107.1-201ENST00000416310 408 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
USP34Q70CQ2 SUB1-203ENST00000502897 562 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.06□□□□□ -1.6
USP34Q70CQ2 UBE2NL-201ENST00000618570 1185 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
USP34Q70CQ2 AC018765.1-201ENST00000623357 3446 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
USP34Q70CQ2 MRO-201ENST00000256425 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
USP34Q70CQ2 COL12A1-211ENST00000615798 11579 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
USP34Q70CQ2 KIAA1551-201ENST00000312561 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
USP34Q70CQ2 AL513550.1-201ENST00000418945 1638 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
USP34Q70CQ2 OR5B2-202ENST00000641342 2184 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
USP34Q70CQ2 GMDS-AS1-202ENST00000505870 8217 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
USP34Q70CQ2 PRPF38AP1-201ENST00000451976 933 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
USP34Q70CQ2 AC119751.5-201ENST00000514077 770 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
USP34Q70CQ2 AP003080.1-202ENST00000526526 915 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
USP34Q70CQ2 AL133485.1-201ENST00000555966 392 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
USP34Q70CQ2 AC074101.1-201ENST00000637861 241 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
USP34Q70CQ2 SCUBE3-201ENST00000274938 7356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
USP34Q70CQ2 OR8H2-201ENST00000313503 3088 ntAPPRIS P2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
USP34Q70CQ2 AC106886.5-201ENST00000380361 11692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
USP34Q70CQ2 MECOM-219ENST00000628990 4835 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
USP34Q70CQ2 CD200R1-201ENST00000295863 1692 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
USP34Q70CQ2 CD109-202ENST00000422508 9221 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
USP34Q70CQ2 GCSAML-203ENST00000366491 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
USP34Q70CQ2 ALB-220ENST00000621628 1606 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
USP34Q70CQ2 CSMD1-206ENST00000520002 11740 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
USP34Q70CQ2 CSMD1-216ENST00000602557 11740 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
USP34Q70CQ2 RPL23AP17-201ENST00000401064 499 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
USP34Q70CQ2 RPS29P10-201ENST00000439197 166 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
USP34Q70CQ2 FHP1-201ENST00000442741 703 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
USP34Q70CQ2 ARL2BPP10-201ENST00000446487 531 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
USP34Q70CQ2 SNORA31.9-201ENST00000516429 84 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
USP34Q70CQ2 MTCO1P49-201ENST00000523429 802 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
USP34Q70CQ2 AC012339.2-201ENST00000523996 453 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
USP34Q70CQ2 LINC01966-201ENST00000595809 821 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
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