Protein–RNA interactions for Protein: Q15399

TLR1, Toll-like receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 786 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLR1Q15399 AC079097.1-201ENST00000512187 1399 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
TLR1Q15399 TRIM42-201ENST00000286349 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
TLR1Q15399 WNK3-203ENST00000375169 11172 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
TLR1Q15399 AL133320.1-201ENST00000621423 2352 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
TLR1Q15399 AKAP13-203ENST00000394518 13215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
TLR1Q15399 MCCC1-210ENST00000492597 2774 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
TLR1Q15399 GTF2H3-212ENST00000543341 3329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
TLR1Q15399 LINC01440-201ENST00000416190 1340 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
TLR1Q15399 INTS7-204ENST00000440600 3136 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
TLR1Q15399 AL359538.1-201ENST00000453498 1710 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
TLR1Q15399 HSPD1P1-201ENST00000503199 1726 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
TLR1Q15399 CARD8-202ENST00000391898 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
TLR1Q15399 NCKAP5-203ENST00000405974 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
TLR1Q15399 CARF-202ENST00000402905 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
TLR1Q15399 ANK2-212ENST00000506722 8051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
TLR1Q15399 RNU6-839P-201ENST00000363347 108 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
TLR1Q15399 RN7SKP50-201ENST00000364694 315 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
TLR1Q15399 HBS1L-202ENST00000367820 638 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
TLR1Q15399 S100A5-202ENST00000368718 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
TLR1Q15399 FABP3-201ENST00000373713 725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
TLR1Q15399 DEC1-201ENST00000374016 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
TLR1Q15399 RPS3AP36-201ENST00000398190 775 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
TLR1Q15399 BTBD9-203ENST00000403056 1155 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
TLR1Q15399 PKMP3-201ENST00000405497 715 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
TLR1Q15399 SNORA11C-201ENST00000408532 129 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
TLR1Q15399 AC011753.4-201ENST00000417974 311 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
TLR1Q15399 AL157884.1-201ENST00000424561 454 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
TLR1Q15399 GAPDHP51-201ENST00000426454 1000 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
TLR1Q15399 SKP1P3-201ENST00000429280 487 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
TLR1Q15399 AL157402.1-201ENST00000429469 363 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
TLR1Q15399 AC000362.1-201ENST00000433725 425 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
TLR1Q15399 AF127936.1-201ENST00000435315 695 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
TLR1Q15399 AL592464.2-201ENST00000457440 607 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
TLR1Q15399 SULT1D1P-201ENST00000458020 882 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
TLR1Q15399 AC110749.1-201ENST00000462007 357 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
TLR1Q15399 AC111000.3-201ENST00000508057 576 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
TLR1Q15399 AC090103.1-201ENST00000520386 485 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
TLR1Q15399 AC008676.1-202ENST00000520658 545 ntTSL 4 BASIC7.3□□□□□ -1.24
TLR1Q15399 AC100782.1-201ENST00000520778 590 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
TLR1Q15399 IGLVI-42-201ENST00000522485 381 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
TLR1Q15399 AP001992.1-204ENST00000525104 687 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
TLR1Q15399 AP005597.2-201ENST00000526238 341 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
TLR1Q15399 RAB30-205ENST00000527633 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
TLR1Q15399 AC126755.2-209ENST00000531453 699 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
TLR1Q15399 TNFRSF17-201ENST00000053243 994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
TLR1Q15399 AC127526.3-201ENST00000534291 450 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
TLR1Q15399 AC008013.2-201ENST00000537555 348 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
TLR1Q15399 AC138969.1-212ENST00000541593 699 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
TLR1Q15399 NPIPA8-202ENST00000541810 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
TLR1Q15399 NPIPA5-203ENST00000543801 699 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
TLR1Q15399 NPIPP1-203ENST00000547107 1071 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
TLR1Q15399 NPIPA3-203ENST00000552140 1053 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
TLR1Q15399 NPIPA2-203ENST00000553201 1053 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
TLR1Q15399 WDR61-205ENST00000558459 884 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
TLR1Q15399 ARPP19-205ENST00000563566 568 ntTSL 4 BASIC7.3□□□□□ -1.24
TLR1Q15399 AC087301.1-201ENST00000579037 321 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
TLR1Q15399 RN7SL237P-201ENST00000580912 287 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
TLR1Q15399 PPP4R1-AS1-201ENST00000582435 379 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
TLR1Q15399 AC005884.2-201ENST00000593107 247 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
TLR1Q15399 AC022239.4-201ENST00000602626 504 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
TLR1Q15399 AC007262.1-201ENST00000604099 321 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
TLR1Q15399 AL035413.2-201ENST00000604801 525 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
TLR1Q15399 RNU6-88P-201ENST00000606801 100 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
TLR1Q15399 C9orf153-205ENST00000617985 333 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
TLR1Q15399 SPINK6-203ENST00000621437 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
TLR1Q15399 OFCC1-218ENST00000622909 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
TLR1Q15399 NR1I3-235ENST00000628566 1201 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
TLR1Q15399 SAMMSON-227ENST00000642114 1199 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
TLR1Q15399 KAT6B-204ENST00000372724 7106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
TLR1Q15399 CLTC-210ENST00000579456 2301 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
TLR1Q15399 GIF-201ENST00000257248 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
TLR1Q15399 CTNNA1-201ENST00000302763 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
TLR1Q15399 PARP9-202ENST00000462315 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
TLR1Q15399 RAPGEF6-208ENST00000509018 8357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
TLR1Q15399 ZNF426-202ENST00000535489 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
TLR1Q15399 DAZ2-208ENST00000400493 3516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
TLR1Q15399 AKAP5-201ENST00000320636 2601 ntAPPRIS P1 BASIC7.3□□□□□ -1.24
TLR1Q15399 PSMC1P7-201ENST00000495689 1315 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
TLR1Q15399 AL136298.2-201ENST00000556497 1570 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
TLR1Q15399 FHL1-227ENST00000628568 2304 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
TLR1Q15399 CACNA2D3-210ENST00000490478 3557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
TLR1Q15399 SH3D19-203ENST00000409598 5284 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
TLR1Q15399 NFX1-203ENST00000379540 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
TLR1Q15399 STK4-202ENST00000372806 6342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
TLR1Q15399 AL353795.1-201ENST00000439134 1775 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
TLR1Q15399 MAPK10-323ENST00000641493 3207 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
TLR1Q15399 FABP4-201ENST00000256104 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
TLR1Q15399 Y_RNA.97-201ENST00000363094 102 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
TLR1Q15399 ZNF292-202ENST00000369577 10610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
TLR1Q15399 RPSAP72-201ENST00000407020 358 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
TLR1Q15399 PSMA4-202ENST00000413382 1019 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
TLR1Q15399 BMS1P17-201ENST00000413661 723 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
TLR1Q15399 RANP6-201ENST00000413691 644 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
TLR1Q15399 HMGB1P11-201ENST00000413899 637 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
TLR1Q15399 RPS3AP9-201ENST00000417027 792 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
TLR1Q15399 LINC01707-201ENST00000425517 627 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
TLR1Q15399 LINC00382-201ENST00000427918 890 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
TLR1Q15399 RPL7P29-201ENST00000437151 728 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
TLR1Q15399 CYP2C56P-201ENST00000440076 291 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
TLR1Q15399 BMS1P10-201ENST00000443754 1120 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
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