Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ2

KRTAP9-4, Keratin-associated protein 9-4, humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-4Q9BYQ2 ZMYND11-217ENST00000627286 3914 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 C1orf127-201ENST00000377004 2761 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 KDM6A-201ENST00000377967 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 ANKRD20A1-201ENST00000562196 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC048382.5-201ENST00000618330 3667 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 CDK5RAP1-210ENST00000473997 1930 ntTSL 2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 HACL1-213ENST00000628377 2214 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 TTLL6-205ENST00000433608 2548 ntTSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 LINC02535-201ENST00000455071 2513 ntTSL 2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 LINC02355-201ENST00000503100 2520 ntTSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 TGM5-206ENST00000611276 2510 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 TWNK-201ENST00000311916 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC098679.3-201ENST00000512016 3115 ntTSL 2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC090643.1-201ENST00000623600 3100 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 ASPH-205ENST00000445642 3717 ntTSL 2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 DHX38-201ENST00000268482 4608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 FBXW8-202ENST00000455858 4648 ntTSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 ABCA3-202ENST00000382381 6446 ntTSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 WDR62-203ENST00000401500 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 HERC6-201ENST00000264346 3779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 SESN2-201ENST00000253063 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 LHX6-204ENST00000394319 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 CACNA2D2-206ENST00000479441 3453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 TMC2-201ENST00000358864 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 VWA8-203ENST00000379310 7147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 AP000533.2-201ENST00000417863 2260 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC092279.1-202ENST00000597683 1966 ntTSL 2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 SORBS1-201ENST00000277982 3517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 LRTM2-202ENST00000535041 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 TTC33-201ENST00000337702 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 COL11A1-210ENST00000512756 5442 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 FAM237B-201ENST00000637645 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 FAM105A-201ENST00000274217 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 GABPB1-203ENST00000380877 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 FLNB-203ENST00000419752 2002 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 ENPP2-203ENST00000427067 3271 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 CARD14-209ENST00000573882 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 CCNJL-208ENST00000541762 2965 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 EPB41-202ENST00000347529 2676 ntTSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 PTPRG-AS1-204ENST00000474795 2661 ntTSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 HEXIM1-201ENST00000332499 3600 ntAPPRIS P1 BASIC3.36□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 DOT1L-201ENST00000398665 7436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 UTS2B-201ENST00000340524 2395 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 GRM3-201ENST00000361669 4268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 FGD3-202ENST00000375482 3321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 SETD4-207ENST00000399215 4272 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 SPTBN2-204ENST00000529997 8085 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 TRIM6-212ENST00000621176 3005 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 NCALD-202ENST00000311028 3655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 LDLRAD4-201ENST00000359446 8486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 RND3-201ENST00000263895 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 MAGED1-201ENST00000326587 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 FAM225B-201ENST00000423546 5629 ntTSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 LMO3-209ENST00000447609 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 DLGAP1-212ENST00000515196 5314 ntTSL 2 BASIC3.35□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 VRK3-223ENST00000601341 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.35□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 ZFP1-203ENST00000464850 3067 ntTSL 2 BASIC3.35□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 TNPO2-210ENST00000588216 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 UGT3A1-207ENST00000625798 3097 ntTSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 C2orf69-201ENST00000319974 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 RBMXL3-201ENST00000424776 3442 ntAPPRIS P1 BASIC3.35□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 COLQ-201ENST00000383781 2784 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 M6PR-201ENST00000000412 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 ADAMTSL1-205ENST00000380548 8030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 ACTN4P1-201ENST00000514175 1451 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 CEACAM20-205ENST00000620096 1494 ntTSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 HM13-204ENST00000398174 3792 ntTSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 HIST1H2BN-203ENST00000606613 4137 ntTSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 EXD2-201ENST00000312994 5107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.35□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 SNX14-201ENST00000314673 3486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC018628.1-201ENST00000624147 3819 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 CDC6-201ENST00000209728 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 TCF7L2-221ENST00000545257 2160 ntTSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 PLCXD1-201ENST00000381657 5507 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 NT5E-201ENST00000257770 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 LINC-PINT-208ENST00000451786 3505 ntTSL 2 BASIC3.35□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC098650.1-201ENST00000635992 3535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 GP1BA-201ENST00000329125 2501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 SLC17A2-203ENST00000377850 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC113208.3-201ENST00000637356 2523 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 KCNMA1-285ENST00000640605 3864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 AP4S1-204ENST00000542754 4243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 EIF3C-204ENST00000564243 2870 ntTSL 2 BASIC3.35□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 GRK7-201ENST00000264952 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 KIF20A-201ENST00000394894 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 PDE6B-212ENST00000496514 3232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 IFRD1-217ENST00000621379 3232 ntTSL 2 BASIC3.35□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 IQCB1-201ENST00000310864 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 ZNF714-201ENST00000425625 2562 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 FKTN-209ENST00000602661 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 MANBA-201ENST00000226578 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 CYB5R3-202ENST00000361740 2938 ntTSL 2 BASIC3.35□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 CNOT4-205ENST00000423368 3297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 KCNN1-201ENST00000222249 3625 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 KIAA0513-201ENST00000258180 7404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 PKP2-202ENST00000340811 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 ZKSCAN3-201ENST00000252211 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 WDR70-201ENST00000265107 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 CHRNB3-201ENST00000289957 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 SUV39H1-201ENST00000337852 2978 ntTSL 2 BASIC3.35□□□□□ -1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 137.3 ms