Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4K3

TRAF6, TNF receptor-associated factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF6Q9Y4K3 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRAF6Q9Y4K3 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRAF6Q9Y4K3 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRAF6Q9Y4K3 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRAF6Q9Y4K3 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRAF6Q9Y4K3 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRAF6Q9Y4K3 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRAF6Q9Y4K3 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRAF6Q9Y4K3 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRAF6Q9Y4K3 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRAF6Q9Y4K3 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRAF6Q9Y4K3 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRAF6Q9Y4K3 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRAF6Q9Y4K3 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRAF6Q9Y4K3 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRAF6Q9Y4K3 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRAF6Q9Y4K3 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRAF6Q9Y4K3 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRAF6Q9Y4K3 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
TRAF6Q9Y4K3 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRAF6Q9Y4K3 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRAF6Q9Y4K3 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRAF6Q9Y4K3 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRAF6Q9Y4K3 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRAF6Q9Y4K3 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRAF6Q9Y4K3 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRAF6Q9Y4K3 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRAF6Q9Y4K3 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRAF6Q9Y4K3 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRAF6Q9Y4K3 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRAF6Q9Y4K3 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRAF6Q9Y4K3 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRAF6Q9Y4K3 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRAF6Q9Y4K3 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRAF6Q9Y4K3 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRAF6Q9Y4K3 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRAF6Q9Y4K3 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRAF6Q9Y4K3 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRAF6Q9Y4K3 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRAF6Q9Y4K3 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRAF6Q9Y4K3 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
TRAF6Q9Y4K3 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRAF6Q9Y4K3 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRAF6Q9Y4K3 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRAF6Q9Y4K3 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
TRAF6Q9Y4K3 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRAF6Q9Y4K3 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRAF6Q9Y4K3 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRAF6Q9Y4K3 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRAF6Q9Y4K3 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRAF6Q9Y4K3 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRAF6Q9Y4K3 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRAF6Q9Y4K3 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRAF6Q9Y4K3 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRAF6Q9Y4K3 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRAF6Q9Y4K3 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRAF6Q9Y4K3 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRAF6Q9Y4K3 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TRAF6Q9Y4K3 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TRAF6Q9Y4K3 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
TRAF6Q9Y4K3 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TRAF6Q9Y4K3 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TRAF6Q9Y4K3 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TRAF6Q9Y4K3 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TRAF6Q9Y4K3 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.65
TRAF6Q9Y4K3 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
TRAF6Q9Y4K3 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
TRAF6Q9Y4K3 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRAF6Q9Y4K3 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRAF6Q9Y4K3 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRAF6Q9Y4K3 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRAF6Q9Y4K3 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRAF6Q9Y4K3 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRAF6Q9Y4K3 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRAF6Q9Y4K3 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRAF6Q9Y4K3 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRAF6Q9Y4K3 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRAF6Q9Y4K3 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRAF6Q9Y4K3 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRAF6Q9Y4K3 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRAF6Q9Y4K3 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRAF6Q9Y4K3 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRAF6Q9Y4K3 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRAF6Q9Y4K3 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRAF6Q9Y4K3 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRAF6Q9Y4K3 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRAF6Q9Y4K3 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRAF6Q9Y4K3 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRAF6Q9Y4K3 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
TRAF6Q9Y4K3 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
TRAF6Q9Y4K3 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRAF6Q9Y4K3 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRAF6Q9Y4K3 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRAF6Q9Y4K3 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRAF6Q9Y4K3 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRAF6Q9Y4K3 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRAF6Q9Y4K3 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRAF6Q9Y4K3 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRAF6Q9Y4K3 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRAF6Q9Y4K3 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms