Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2W7

KCNIP3, Calsenilin, humanhuman

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNIP3Q9Y2W7 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KCNIP3Q9Y2W7 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KCNIP3Q9Y2W7 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KCNIP3Q9Y2W7 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KCNIP3Q9Y2W7 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KCNIP3Q9Y2W7 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KCNIP3Q9Y2W7 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KCNIP3Q9Y2W7 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KCNIP3Q9Y2W7 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KCNIP3Q9Y2W7 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KCNIP3Q9Y2W7 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KCNIP3Q9Y2W7 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KCNIP3Q9Y2W7 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
KCNIP3Q9Y2W7 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KCNIP3Q9Y2W7 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
KCNIP3Q9Y2W7 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KCNIP3Q9Y2W7 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KCNIP3Q9Y2W7 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
KCNIP3Q9Y2W7 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KCNIP3Q9Y2W7 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KCNIP3Q9Y2W7 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KCNIP3Q9Y2W7 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KCNIP3Q9Y2W7 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KCNIP3Q9Y2W7 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KCNIP3Q9Y2W7 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KCNIP3Q9Y2W7 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
KCNIP3Q9Y2W7 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KCNIP3Q9Y2W7 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KCNIP3Q9Y2W7 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
KCNIP3Q9Y2W7 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KCNIP3Q9Y2W7 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KCNIP3Q9Y2W7 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KCNIP3Q9Y2W7 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KCNIP3Q9Y2W7 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KCNIP3Q9Y2W7 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KCNIP3Q9Y2W7 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KCNIP3Q9Y2W7 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KCNIP3Q9Y2W7 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KCNIP3Q9Y2W7 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KCNIP3Q9Y2W7 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KCNIP3Q9Y2W7 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KCNIP3Q9Y2W7 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KCNIP3Q9Y2W7 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
KCNIP3Q9Y2W7 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
KCNIP3Q9Y2W7 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KCNIP3Q9Y2W7 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KCNIP3Q9Y2W7 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KCNIP3Q9Y2W7 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KCNIP3Q9Y2W7 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KCNIP3Q9Y2W7 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KCNIP3Q9Y2W7 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KCNIP3Q9Y2W7 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
KCNIP3Q9Y2W7 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KCNIP3Q9Y2W7 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KCNIP3Q9Y2W7 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KCNIP3Q9Y2W7 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KCNIP3Q9Y2W7 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KCNIP3Q9Y2W7 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KCNIP3Q9Y2W7 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KCNIP3Q9Y2W7 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KCNIP3Q9Y2W7 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KCNIP3Q9Y2W7 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KCNIP3Q9Y2W7 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KCNIP3Q9Y2W7 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KCNIP3Q9Y2W7 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KCNIP3Q9Y2W7 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KCNIP3Q9Y2W7 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KCNIP3Q9Y2W7 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KCNIP3Q9Y2W7 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KCNIP3Q9Y2W7 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KCNIP3Q9Y2W7 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KCNIP3Q9Y2W7 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KCNIP3Q9Y2W7 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
KCNIP3Q9Y2W7 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KCNIP3Q9Y2W7 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KCNIP3Q9Y2W7 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KCNIP3Q9Y2W7 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
KCNIP3Q9Y2W7 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KCNIP3Q9Y2W7 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KCNIP3Q9Y2W7 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KCNIP3Q9Y2W7 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KCNIP3Q9Y2W7 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KCNIP3Q9Y2W7 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KCNIP3Q9Y2W7 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KCNIP3Q9Y2W7 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KCNIP3Q9Y2W7 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KCNIP3Q9Y2W7 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KCNIP3Q9Y2W7 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KCNIP3Q9Y2W7 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KCNIP3Q9Y2W7 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KCNIP3Q9Y2W7 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNIP3Q9Y2W7 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNIP3Q9Y2W7 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNIP3Q9Y2W7 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNIP3Q9Y2W7 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNIP3Q9Y2W7 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNIP3Q9Y2W7 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNIP3Q9Y2W7 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNIP3Q9Y2W7 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNIP3Q9Y2W7 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms