Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ49

NEU3, Sialidase-3, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEU3Q9UQ49 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NEU3Q9UQ49 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NEU3Q9UQ49 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NEU3Q9UQ49 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NEU3Q9UQ49 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NEU3Q9UQ49 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NEU3Q9UQ49 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NEU3Q9UQ49 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NEU3Q9UQ49 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NEU3Q9UQ49 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NEU3Q9UQ49 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NEU3Q9UQ49 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NEU3Q9UQ49 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NEU3Q9UQ49 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NEU3Q9UQ49 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NEU3Q9UQ49 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NEU3Q9UQ49 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NEU3Q9UQ49 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NEU3Q9UQ49 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NEU3Q9UQ49 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NEU3Q9UQ49 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NEU3Q9UQ49 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NEU3Q9UQ49 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NEU3Q9UQ49 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NEU3Q9UQ49 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NEU3Q9UQ49 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NEU3Q9UQ49 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NEU3Q9UQ49 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NEU3Q9UQ49 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
NEU3Q9UQ49 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NEU3Q9UQ49 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NEU3Q9UQ49 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NEU3Q9UQ49 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NEU3Q9UQ49 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NEU3Q9UQ49 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NEU3Q9UQ49 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
NEU3Q9UQ49 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NEU3Q9UQ49 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NEU3Q9UQ49 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NEU3Q9UQ49 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NEU3Q9UQ49 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NEU3Q9UQ49 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NEU3Q9UQ49 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NEU3Q9UQ49 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NEU3Q9UQ49 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NEU3Q9UQ49 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NEU3Q9UQ49 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NEU3Q9UQ49 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NEU3Q9UQ49 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NEU3Q9UQ49 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NEU3Q9UQ49 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NEU3Q9UQ49 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NEU3Q9UQ49 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NEU3Q9UQ49 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NEU3Q9UQ49 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NEU3Q9UQ49 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NEU3Q9UQ49 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NEU3Q9UQ49 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NEU3Q9UQ49 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NEU3Q9UQ49 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NEU3Q9UQ49 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NEU3Q9UQ49 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NEU3Q9UQ49 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NEU3Q9UQ49 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NEU3Q9UQ49 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NEU3Q9UQ49 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NEU3Q9UQ49 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NEU3Q9UQ49 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NEU3Q9UQ49 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NEU3Q9UQ49 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NEU3Q9UQ49 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NEU3Q9UQ49 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NEU3Q9UQ49 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NEU3Q9UQ49 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NEU3Q9UQ49 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NEU3Q9UQ49 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NEU3Q9UQ49 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NEU3Q9UQ49 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NEU3Q9UQ49 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NEU3Q9UQ49 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NEU3Q9UQ49 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NEU3Q9UQ49 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NEU3Q9UQ49 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NEU3Q9UQ49 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
NEU3Q9UQ49 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
NEU3Q9UQ49 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
NEU3Q9UQ49 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
NEU3Q9UQ49 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
NEU3Q9UQ49 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
NEU3Q9UQ49 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
NEU3Q9UQ49 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
NEU3Q9UQ49 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
NEU3Q9UQ49 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
NEU3Q9UQ49 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NEU3Q9UQ49 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NEU3Q9UQ49 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NEU3Q9UQ49 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NEU3Q9UQ49 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NEU3Q9UQ49 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NEU3Q9UQ49 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms