Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMQ3

BARX2, Homeobox protein BarH-like 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BARX2Q9UMQ3 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BARX2Q9UMQ3 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BARX2Q9UMQ3 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC21.27■■□□□ 1
BARX2Q9UMQ3 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC21.27■■□□□ 1
BARX2Q9UMQ3 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
BARX2Q9UMQ3 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BARX2Q9UMQ3 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
BARX2Q9UMQ3 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
BARX2Q9UMQ3 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BARX2Q9UMQ3 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC21.27■■□□□ 1
BARX2Q9UMQ3 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
BARX2Q9UMQ3 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
BARX2Q9UMQ3 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
BARX2Q9UMQ3 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
BARX2Q9UMQ3 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
BARX2Q9UMQ3 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BARX2Q9UMQ3 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC21.27■■□□□ 1
BARX2Q9UMQ3 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BARX2Q9UMQ3 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BARX2Q9UMQ3 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BARX2Q9UMQ3 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
BARX2Q9UMQ3 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
BARX2Q9UMQ3 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
BARX2Q9UMQ3 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
BARX2Q9UMQ3 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
BARX2Q9UMQ3 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
BARX2Q9UMQ3 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
BARX2Q9UMQ3 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BARX2Q9UMQ3 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
BARX2Q9UMQ3 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BARX2Q9UMQ3 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BARX2Q9UMQ3 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
BARX2Q9UMQ3 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
BARX2Q9UMQ3 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
BARX2Q9UMQ3 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BARX2Q9UMQ3 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
BARX2Q9UMQ3 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
BARX2Q9UMQ3 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BARX2Q9UMQ3 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
BARX2Q9UMQ3 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BARX2Q9UMQ3 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
BARX2Q9UMQ3 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BARX2Q9UMQ3 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
BARX2Q9UMQ3 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BARX2Q9UMQ3 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BARX2Q9UMQ3 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BARX2Q9UMQ3 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BARX2Q9UMQ3 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
BARX2Q9UMQ3 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
BARX2Q9UMQ3 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BARX2Q9UMQ3 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BARX2Q9UMQ3 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
BARX2Q9UMQ3 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BARX2Q9UMQ3 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
BARX2Q9UMQ3 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
BARX2Q9UMQ3 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BARX2Q9UMQ3 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BARX2Q9UMQ3 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
BARX2Q9UMQ3 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BARX2Q9UMQ3 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BARX2Q9UMQ3 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BARX2Q9UMQ3 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BARX2Q9UMQ3 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
BARX2Q9UMQ3 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BARX2Q9UMQ3 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
BARX2Q9UMQ3 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
BARX2Q9UMQ3 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
BARX2Q9UMQ3 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BARX2Q9UMQ3 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BARX2Q9UMQ3 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
BARX2Q9UMQ3 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BARX2Q9UMQ3 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BARX2Q9UMQ3 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BARX2Q9UMQ3 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
BARX2Q9UMQ3 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BARX2Q9UMQ3 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
BARX2Q9UMQ3 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BARX2Q9UMQ3 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
BARX2Q9UMQ3 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
BARX2Q9UMQ3 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
BARX2Q9UMQ3 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
BARX2Q9UMQ3 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BARX2Q9UMQ3 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
BARX2Q9UMQ3 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BARX2Q9UMQ3 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BARX2Q9UMQ3 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BARX2Q9UMQ3 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BARX2Q9UMQ3 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BARX2Q9UMQ3 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BARX2Q9UMQ3 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
BARX2Q9UMQ3 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
BARX2Q9UMQ3 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BARX2Q9UMQ3 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BARX2Q9UMQ3 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BARX2Q9UMQ3 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
BARX2Q9UMQ3 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
BARX2Q9UMQ3 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
BARX2Q9UMQ3 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
BARX2Q9UMQ3 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BARX2Q9UMQ3 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms