Protein–RNA interactions for Protein: Q9NU39

FOXD4L1, Forkhead box protein D4-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4L1Q9NU39 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FOXD4L1Q9NU39 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FOXD4L1Q9NU39 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FOXD4L1Q9NU39 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FOXD4L1Q9NU39 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FOXD4L1Q9NU39 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
FOXD4L1Q9NU39 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
FOXD4L1Q9NU39 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FOXD4L1Q9NU39 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FOXD4L1Q9NU39 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FOXD4L1Q9NU39 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FOXD4L1Q9NU39 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FOXD4L1Q9NU39 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FOXD4L1Q9NU39 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FOXD4L1Q9NU39 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
FOXD4L1Q9NU39 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FOXD4L1Q9NU39 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FOXD4L1Q9NU39 AC121493.1-201ENST00000602316 450 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
FOXD4L1Q9NU39 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FOXD4L1Q9NU39 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FOXD4L1Q9NU39 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FOXD4L1Q9NU39 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FOXD4L1Q9NU39 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FOXD4L1Q9NU39 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FOXD4L1Q9NU39 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FOXD4L1Q9NU39 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FOXD4L1Q9NU39 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
FOXD4L1Q9NU39 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FOXD4L1Q9NU39 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FOXD4L1Q9NU39 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FOXD4L1Q9NU39 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FOXD4L1Q9NU39 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FOXD4L1Q9NU39 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FOXD4L1Q9NU39 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FOXD4L1Q9NU39 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FOXD4L1Q9NU39 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FOXD4L1Q9NU39 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FOXD4L1Q9NU39 LINC01014-203ENST00000455307 548 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FOXD4L1Q9NU39 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FOXD4L1Q9NU39 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FOXD4L1Q9NU39 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
FOXD4L1Q9NU39 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
FOXD4L1Q9NU39 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FOXD4L1Q9NU39 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FOXD4L1Q9NU39 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FOXD4L1Q9NU39 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FOXD4L1Q9NU39 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FOXD4L1Q9NU39 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FOXD4L1Q9NU39 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FOXD4L1Q9NU39 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FOXD4L1Q9NU39 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FOXD4L1Q9NU39 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FOXD4L1Q9NU39 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FOXD4L1Q9NU39 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FOXD4L1Q9NU39 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FOXD4L1Q9NU39 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FOXD4L1Q9NU39 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FOXD4L1Q9NU39 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FOXD4L1Q9NU39 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FOXD4L1Q9NU39 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FOXD4L1Q9NU39 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FOXD4L1Q9NU39 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FOXD4L1Q9NU39 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FOXD4L1Q9NU39 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
FOXD4L1Q9NU39 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FOXD4L1Q9NU39 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FOXD4L1Q9NU39 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FOXD4L1Q9NU39 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FOXD4L1Q9NU39 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FOXD4L1Q9NU39 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FOXD4L1Q9NU39 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FOXD4L1Q9NU39 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FOXD4L1Q9NU39 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FOXD4L1Q9NU39 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FOXD4L1Q9NU39 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FOXD4L1Q9NU39 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FOXD4L1Q9NU39 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FOXD4L1Q9NU39 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FOXD4L1Q9NU39 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FOXD4L1Q9NU39 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FOXD4L1Q9NU39 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FOXD4L1Q9NU39 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
FOXD4L1Q9NU39 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
FOXD4L1Q9NU39 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
FOXD4L1Q9NU39 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
FOXD4L1Q9NU39 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
FOXD4L1Q9NU39 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
FOXD4L1Q9NU39 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
FOXD4L1Q9NU39 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
FOXD4L1Q9NU39 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
FOXD4L1Q9NU39 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
FOXD4L1Q9NU39 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
FOXD4L1Q9NU39 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
FOXD4L1Q9NU39 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
FOXD4L1Q9NU39 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
FOXD4L1Q9NU39 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
FOXD4L1Q9NU39 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
FOXD4L1Q9NU39 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
FOXD4L1Q9NU39 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FOXD4L1Q9NU39 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.9 ms