Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRX6

TMEM167B, Protein kish-B, humanhuman

Predictions only

Length 74 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM167BQ9NRX6 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM167BQ9NRX6 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM167BQ9NRX6 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM167BQ9NRX6 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM167BQ9NRX6 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM167BQ9NRX6 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM167BQ9NRX6 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMEM167BQ9NRX6 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMEM167BQ9NRX6 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMEM167BQ9NRX6 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMEM167BQ9NRX6 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMEM167BQ9NRX6 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMEM167BQ9NRX6 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMEM167BQ9NRX6 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMEM167BQ9NRX6 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMEM167BQ9NRX6 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMEM167BQ9NRX6 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMEM167BQ9NRX6 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMEM167BQ9NRX6 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMEM167BQ9NRX6 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMEM167BQ9NRX6 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMEM167BQ9NRX6 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMEM167BQ9NRX6 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
TMEM167BQ9NRX6 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMEM167BQ9NRX6 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMEM167BQ9NRX6 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
TMEM167BQ9NRX6 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
TMEM167BQ9NRX6 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TMEM167BQ9NRX6 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TMEM167BQ9NRX6 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TMEM167BQ9NRX6 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TMEM167BQ9NRX6 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TMEM167BQ9NRX6 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TMEM167BQ9NRX6 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TMEM167BQ9NRX6 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TMEM167BQ9NRX6 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TMEM167BQ9NRX6 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TMEM167BQ9NRX6 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TMEM167BQ9NRX6 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TMEM167BQ9NRX6 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TMEM167BQ9NRX6 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TMEM167BQ9NRX6 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TMEM167BQ9NRX6 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMEM167BQ9NRX6 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMEM167BQ9NRX6 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMEM167BQ9NRX6 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMEM167BQ9NRX6 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMEM167BQ9NRX6 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMEM167BQ9NRX6 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMEM167BQ9NRX6 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMEM167BQ9NRX6 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMEM167BQ9NRX6 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMEM167BQ9NRX6 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMEM167BQ9NRX6 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMEM167BQ9NRX6 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMEM167BQ9NRX6 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMEM167BQ9NRX6 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMEM167BQ9NRX6 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
TMEM167BQ9NRX6 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMEM167BQ9NRX6 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMEM167BQ9NRX6 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMEM167BQ9NRX6 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMEM167BQ9NRX6 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMEM167BQ9NRX6 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMEM167BQ9NRX6 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMEM167BQ9NRX6 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMEM167BQ9NRX6 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMEM167BQ9NRX6 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMEM167BQ9NRX6 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMEM167BQ9NRX6 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMEM167BQ9NRX6 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMEM167BQ9NRX6 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMEM167BQ9NRX6 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMEM167BQ9NRX6 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMEM167BQ9NRX6 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMEM167BQ9NRX6 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMEM167BQ9NRX6 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMEM167BQ9NRX6 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMEM167BQ9NRX6 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMEM167BQ9NRX6 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMEM167BQ9NRX6 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMEM167BQ9NRX6 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMEM167BQ9NRX6 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
TMEM167BQ9NRX6 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMEM167BQ9NRX6 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMEM167BQ9NRX6 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMEM167BQ9NRX6 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMEM167BQ9NRX6 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMEM167BQ9NRX6 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMEM167BQ9NRX6 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMEM167BQ9NRX6 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMEM167BQ9NRX6 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMEM167BQ9NRX6 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMEM167BQ9NRX6 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMEM167BQ9NRX6 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
TMEM167BQ9NRX6 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMEM167BQ9NRX6 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMEM167BQ9NRX6 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMEM167BQ9NRX6 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMEM167BQ9NRX6 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms