Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCU9

BRMS1, Breast cancer metastasis-suppressor 1, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRMS1Q9HCU9 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
BRMS1Q9HCU9 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
BRMS1Q9HCU9 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
BRMS1Q9HCU9 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
BRMS1Q9HCU9 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
BRMS1Q9HCU9 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
BRMS1Q9HCU9 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
BRMS1Q9HCU9 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
BRMS1Q9HCU9 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
BRMS1Q9HCU9 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
BRMS1Q9HCU9 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
BRMS1Q9HCU9 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
BRMS1Q9HCU9 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
BRMS1Q9HCU9 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
BRMS1Q9HCU9 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
BRMS1Q9HCU9 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
BRMS1Q9HCU9 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
BRMS1Q9HCU9 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
BRMS1Q9HCU9 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
BRMS1Q9HCU9 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
BRMS1Q9HCU9 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
BRMS1Q9HCU9 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
BRMS1Q9HCU9 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
BRMS1Q9HCU9 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BRMS1Q9HCU9 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BRMS1Q9HCU9 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
BRMS1Q9HCU9 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
BRMS1Q9HCU9 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
BRMS1Q9HCU9 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
BRMS1Q9HCU9 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
BRMS1Q9HCU9 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
BRMS1Q9HCU9 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
BRMS1Q9HCU9 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BRMS1Q9HCU9 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
BRMS1Q9HCU9 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
BRMS1Q9HCU9 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
BRMS1Q9HCU9 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BRMS1Q9HCU9 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BRMS1Q9HCU9 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BRMS1Q9HCU9 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BRMS1Q9HCU9 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BRMS1Q9HCU9 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BRMS1Q9HCU9 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BRMS1Q9HCU9 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BRMS1Q9HCU9 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BRMS1Q9HCU9 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BRMS1Q9HCU9 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BRMS1Q9HCU9 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BRMS1Q9HCU9 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BRMS1Q9HCU9 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BRMS1Q9HCU9 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BRMS1Q9HCU9 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
BRMS1Q9HCU9 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
BRMS1Q9HCU9 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BRMS1Q9HCU9 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BRMS1Q9HCU9 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BRMS1Q9HCU9 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BRMS1Q9HCU9 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BRMS1Q9HCU9 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BRMS1Q9HCU9 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BRMS1Q9HCU9 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BRMS1Q9HCU9 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BRMS1Q9HCU9 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BRMS1Q9HCU9 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BRMS1Q9HCU9 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BRMS1Q9HCU9 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BRMS1Q9HCU9 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BRMS1Q9HCU9 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BRMS1Q9HCU9 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BRMS1Q9HCU9 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BRMS1Q9HCU9 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BRMS1Q9HCU9 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BRMS1Q9HCU9 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BRMS1Q9HCU9 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BRMS1Q9HCU9 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BRMS1Q9HCU9 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
BRMS1Q9HCU9 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BRMS1Q9HCU9 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BRMS1Q9HCU9 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BRMS1Q9HCU9 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BRMS1Q9HCU9 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BRMS1Q9HCU9 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BRMS1Q9HCU9 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BRMS1Q9HCU9 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BRMS1Q9HCU9 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BRMS1Q9HCU9 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BRMS1Q9HCU9 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BRMS1Q9HCU9 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BRMS1Q9HCU9 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BRMS1Q9HCU9 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BRMS1Q9HCU9 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BRMS1Q9HCU9 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BRMS1Q9HCU9 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BRMS1Q9HCU9 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BRMS1Q9HCU9 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BRMS1Q9HCU9 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BRMS1Q9HCU9 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BRMS1Q9HCU9 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BRMS1Q9HCU9 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BRMS1Q9HCU9 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms