Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCQ7

NPVF, Pro-FMRFamide-related neuropeptide VF, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPVFQ9HCQ7 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NPVFQ9HCQ7 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NPVFQ9HCQ7 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NPVFQ9HCQ7 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NPVFQ9HCQ7 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NPVFQ9HCQ7 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NPVFQ9HCQ7 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NPVFQ9HCQ7 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NPVFQ9HCQ7 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NPVFQ9HCQ7 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NPVFQ9HCQ7 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NPVFQ9HCQ7 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NPVFQ9HCQ7 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NPVFQ9HCQ7 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NPVFQ9HCQ7 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NPVFQ9HCQ7 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NPVFQ9HCQ7 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NPVFQ9HCQ7 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NPVFQ9HCQ7 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NPVFQ9HCQ7 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NPVFQ9HCQ7 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NPVFQ9HCQ7 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NPVFQ9HCQ7 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NPVFQ9HCQ7 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
NPVFQ9HCQ7 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NPVFQ9HCQ7 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NPVFQ9HCQ7 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NPVFQ9HCQ7 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NPVFQ9HCQ7 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NPVFQ9HCQ7 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NPVFQ9HCQ7 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NPVFQ9HCQ7 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NPVFQ9HCQ7 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NPVFQ9HCQ7 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NPVFQ9HCQ7 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NPVFQ9HCQ7 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NPVFQ9HCQ7 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NPVFQ9HCQ7 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NPVFQ9HCQ7 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NPVFQ9HCQ7 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NPVFQ9HCQ7 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NPVFQ9HCQ7 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NPVFQ9HCQ7 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NPVFQ9HCQ7 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NPVFQ9HCQ7 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NPVFQ9HCQ7 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NPVFQ9HCQ7 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NPVFQ9HCQ7 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NPVFQ9HCQ7 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NPVFQ9HCQ7 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NPVFQ9HCQ7 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
NPVFQ9HCQ7 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NPVFQ9HCQ7 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
NPVFQ9HCQ7 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NPVFQ9HCQ7 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
NPVFQ9HCQ7 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NPVFQ9HCQ7 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NPVFQ9HCQ7 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NPVFQ9HCQ7 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NPVFQ9HCQ7 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NPVFQ9HCQ7 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NPVFQ9HCQ7 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NPVFQ9HCQ7 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NPVFQ9HCQ7 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NPVFQ9HCQ7 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NPVFQ9HCQ7 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NPVFQ9HCQ7 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NPVFQ9HCQ7 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NPVFQ9HCQ7 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NPVFQ9HCQ7 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NPVFQ9HCQ7 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NPVFQ9HCQ7 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NPVFQ9HCQ7 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NPVFQ9HCQ7 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NPVFQ9HCQ7 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NPVFQ9HCQ7 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NPVFQ9HCQ7 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NPVFQ9HCQ7 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NPVFQ9HCQ7 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NPVFQ9HCQ7 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NPVFQ9HCQ7 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NPVFQ9HCQ7 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NPVFQ9HCQ7 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NPVFQ9HCQ7 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NPVFQ9HCQ7 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NPVFQ9HCQ7 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NPVFQ9HCQ7 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NPVFQ9HCQ7 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NPVFQ9HCQ7 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NPVFQ9HCQ7 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NPVFQ9HCQ7 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NPVFQ9HCQ7 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NPVFQ9HCQ7 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NPVFQ9HCQ7 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NPVFQ9HCQ7 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
NPVFQ9HCQ7 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
NPVFQ9HCQ7 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NPVFQ9HCQ7 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NPVFQ9HCQ7 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NPVFQ9HCQ7 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms