Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4D0

CLSTN2, Calsyntenin-2, humanhuman

Predictions only

Length 955 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN2Q9H4D0 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLSTN2Q9H4D0 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CLSTN2Q9H4D0 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLSTN2Q9H4D0 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLSTN2Q9H4D0 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLSTN2Q9H4D0 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLSTN2Q9H4D0 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLSTN2Q9H4D0 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLSTN2Q9H4D0 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLSTN2Q9H4D0 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLSTN2Q9H4D0 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLSTN2Q9H4D0 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLSTN2Q9H4D0 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLSTN2Q9H4D0 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLSTN2Q9H4D0 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLSTN2Q9H4D0 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLSTN2Q9H4D0 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLSTN2Q9H4D0 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLSTN2Q9H4D0 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLSTN2Q9H4D0 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLSTN2Q9H4D0 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLSTN2Q9H4D0 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLSTN2Q9H4D0 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLSTN2Q9H4D0 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLSTN2Q9H4D0 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLSTN2Q9H4D0 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLSTN2Q9H4D0 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLSTN2Q9H4D0 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLSTN2Q9H4D0 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLSTN2Q9H4D0 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLSTN2Q9H4D0 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLSTN2Q9H4D0 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLSTN2Q9H4D0 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLSTN2Q9H4D0 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLSTN2Q9H4D0 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLSTN2Q9H4D0 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLSTN2Q9H4D0 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLSTN2Q9H4D0 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLSTN2Q9H4D0 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CLSTN2Q9H4D0 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLSTN2Q9H4D0 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLSTN2Q9H4D0 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLSTN2Q9H4D0 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLSTN2Q9H4D0 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLSTN2Q9H4D0 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLSTN2Q9H4D0 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLSTN2Q9H4D0 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLSTN2Q9H4D0 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLSTN2Q9H4D0 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLSTN2Q9H4D0 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLSTN2Q9H4D0 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLSTN2Q9H4D0 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLSTN2Q9H4D0 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLSTN2Q9H4D0 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLSTN2Q9H4D0 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLSTN2Q9H4D0 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLSTN2Q9H4D0 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLSTN2Q9H4D0 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CLSTN2Q9H4D0 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLSTN2Q9H4D0 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLSTN2Q9H4D0 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLSTN2Q9H4D0 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CLSTN2Q9H4D0 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CLSTN2Q9H4D0 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLSTN2Q9H4D0 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLSTN2Q9H4D0 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLSTN2Q9H4D0 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLSTN2Q9H4D0 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLSTN2Q9H4D0 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLSTN2Q9H4D0 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLSTN2Q9H4D0 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLSTN2Q9H4D0 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLSTN2Q9H4D0 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLSTN2Q9H4D0 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLSTN2Q9H4D0 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLSTN2Q9H4D0 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLSTN2Q9H4D0 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLSTN2Q9H4D0 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLSTN2Q9H4D0 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLSTN2Q9H4D0 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLSTN2Q9H4D0 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLSTN2Q9H4D0 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLSTN2Q9H4D0 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLSTN2Q9H4D0 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLSTN2Q9H4D0 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLSTN2Q9H4D0 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLSTN2Q9H4D0 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLSTN2Q9H4D0 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLSTN2Q9H4D0 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLSTN2Q9H4D0 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLSTN2Q9H4D0 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLSTN2Q9H4D0 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLSTN2Q9H4D0 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLSTN2Q9H4D0 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLSTN2Q9H4D0 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLSTN2Q9H4D0 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLSTN2Q9H4D0 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLSTN2Q9H4D0 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLSTN2Q9H4D0 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CLSTN2Q9H4D0 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms