Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY65

NPCDR1, Nasopharyngeal carcinoma down-regulated gene protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPCDR1Q9BY65 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NPCDR1Q9BY65 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NPCDR1Q9BY65 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NPCDR1Q9BY65 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NPCDR1Q9BY65 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NPCDR1Q9BY65 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NPCDR1Q9BY65 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NPCDR1Q9BY65 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NPCDR1Q9BY65 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NPCDR1Q9BY65 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NPCDR1Q9BY65 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NPCDR1Q9BY65 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NPCDR1Q9BY65 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NPCDR1Q9BY65 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NPCDR1Q9BY65 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NPCDR1Q9BY65 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NPCDR1Q9BY65 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NPCDR1Q9BY65 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NPCDR1Q9BY65 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NPCDR1Q9BY65 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NPCDR1Q9BY65 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NPCDR1Q9BY65 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NPCDR1Q9BY65 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NPCDR1Q9BY65 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NPCDR1Q9BY65 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
NPCDR1Q9BY65 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NPCDR1Q9BY65 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NPCDR1Q9BY65 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NPCDR1Q9BY65 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NPCDR1Q9BY65 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NPCDR1Q9BY65 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NPCDR1Q9BY65 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NPCDR1Q9BY65 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NPCDR1Q9BY65 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NPCDR1Q9BY65 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NPCDR1Q9BY65 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NPCDR1Q9BY65 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NPCDR1Q9BY65 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
NPCDR1Q9BY65 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NPCDR1Q9BY65 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NPCDR1Q9BY65 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
NPCDR1Q9BY65 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
NPCDR1Q9BY65 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NPCDR1Q9BY65 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NPCDR1Q9BY65 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NPCDR1Q9BY65 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NPCDR1Q9BY65 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NPCDR1Q9BY65 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
NPCDR1Q9BY65 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NPCDR1Q9BY65 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NPCDR1Q9BY65 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NPCDR1Q9BY65 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NPCDR1Q9BY65 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NPCDR1Q9BY65 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NPCDR1Q9BY65 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NPCDR1Q9BY65 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NPCDR1Q9BY65 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NPCDR1Q9BY65 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NPCDR1Q9BY65 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
NPCDR1Q9BY65 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NPCDR1Q9BY65 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NPCDR1Q9BY65 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NPCDR1Q9BY65 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NPCDR1Q9BY65 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NPCDR1Q9BY65 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NPCDR1Q9BY65 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NPCDR1Q9BY65 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NPCDR1Q9BY65 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NPCDR1Q9BY65 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
NPCDR1Q9BY65 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
NPCDR1Q9BY65 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NPCDR1Q9BY65 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NPCDR1Q9BY65 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NPCDR1Q9BY65 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NPCDR1Q9BY65 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NPCDR1Q9BY65 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NPCDR1Q9BY65 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NPCDR1Q9BY65 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NPCDR1Q9BY65 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NPCDR1Q9BY65 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NPCDR1Q9BY65 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NPCDR1Q9BY65 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NPCDR1Q9BY65 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NPCDR1Q9BY65 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NPCDR1Q9BY65 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NPCDR1Q9BY65 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NPCDR1Q9BY65 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NPCDR1Q9BY65 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NPCDR1Q9BY65 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NPCDR1Q9BY65 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NPCDR1Q9BY65 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NPCDR1Q9BY65 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NPCDR1Q9BY65 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
NPCDR1Q9BY65 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NPCDR1Q9BY65 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NPCDR1Q9BY65 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NPCDR1Q9BY65 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NPCDR1Q9BY65 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NPCDR1Q9BY65 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NPCDR1Q9BY65 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms