Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT78

COPS4, COP9 signalosome complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS4Q9BT78 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
COPS4Q9BT78 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
COPS4Q9BT78 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
COPS4Q9BT78 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
COPS4Q9BT78 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
COPS4Q9BT78 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
COPS4Q9BT78 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
COPS4Q9BT78 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
COPS4Q9BT78 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
COPS4Q9BT78 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
COPS4Q9BT78 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
COPS4Q9BT78 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
COPS4Q9BT78 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
COPS4Q9BT78 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
COPS4Q9BT78 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
COPS4Q9BT78 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
COPS4Q9BT78 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
COPS4Q9BT78 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
COPS4Q9BT78 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
COPS4Q9BT78 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
COPS4Q9BT78 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
COPS4Q9BT78 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
COPS4Q9BT78 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
COPS4Q9BT78 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
COPS4Q9BT78 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
COPS4Q9BT78 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
COPS4Q9BT78 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
COPS4Q9BT78 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
COPS4Q9BT78 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
COPS4Q9BT78 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
COPS4Q9BT78 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
COPS4Q9BT78 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
COPS4Q9BT78 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
COPS4Q9BT78 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
COPS4Q9BT78 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
COPS4Q9BT78 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
COPS4Q9BT78 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
COPS4Q9BT78 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
COPS4Q9BT78 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
COPS4Q9BT78 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
COPS4Q9BT78 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
COPS4Q9BT78 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
COPS4Q9BT78 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
COPS4Q9BT78 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
COPS4Q9BT78 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
COPS4Q9BT78 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
COPS4Q9BT78 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
COPS4Q9BT78 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
COPS4Q9BT78 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
COPS4Q9BT78 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
COPS4Q9BT78 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
COPS4Q9BT78 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
COPS4Q9BT78 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
COPS4Q9BT78 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
COPS4Q9BT78 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
COPS4Q9BT78 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
COPS4Q9BT78 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
COPS4Q9BT78 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
COPS4Q9BT78 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
COPS4Q9BT78 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
COPS4Q9BT78 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
COPS4Q9BT78 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
COPS4Q9BT78 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
COPS4Q9BT78 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
COPS4Q9BT78 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
COPS4Q9BT78 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
COPS4Q9BT78 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
COPS4Q9BT78 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
COPS4Q9BT78 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
COPS4Q9BT78 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
COPS4Q9BT78 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
COPS4Q9BT78 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
COPS4Q9BT78 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
COPS4Q9BT78 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
COPS4Q9BT78 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
COPS4Q9BT78 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
COPS4Q9BT78 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
COPS4Q9BT78 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
COPS4Q9BT78 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
COPS4Q9BT78 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
COPS4Q9BT78 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
COPS4Q9BT78 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
COPS4Q9BT78 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
COPS4Q9BT78 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
COPS4Q9BT78 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
COPS4Q9BT78 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
COPS4Q9BT78 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
COPS4Q9BT78 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
COPS4Q9BT78 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
COPS4Q9BT78 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
COPS4Q9BT78 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
COPS4Q9BT78 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
COPS4Q9BT78 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
COPS4Q9BT78 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
COPS4Q9BT78 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
COPS4Q9BT78 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
COPS4Q9BT78 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
COPS4Q9BT78 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
COPS4Q9BT78 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
COPS4Q9BT78 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms