Protein–RNA interactions for Protein: Q99720

SIGMAR1, Sigma non-opioid intracellular receptor 1, humanhuman

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Length 223 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIGMAR1Q99720 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SIGMAR1Q99720 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SIGMAR1Q99720 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SIGMAR1Q99720 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SIGMAR1Q99720 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SIGMAR1Q99720 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SIGMAR1Q99720 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SIGMAR1Q99720 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SIGMAR1Q99720 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SIGMAR1Q99720 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SIGMAR1Q99720 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SIGMAR1Q99720 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SIGMAR1Q99720 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SIGMAR1Q99720 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SIGMAR1Q99720 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SIGMAR1Q99720 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SIGMAR1Q99720 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SIGMAR1Q99720 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SIGMAR1Q99720 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SIGMAR1Q99720 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SIGMAR1Q99720 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SIGMAR1Q99720 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SIGMAR1Q99720 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
SIGMAR1Q99720 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SIGMAR1Q99720 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SIGMAR1Q99720 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SIGMAR1Q99720 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SIGMAR1Q99720 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SIGMAR1Q99720 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SIGMAR1Q99720 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SIGMAR1Q99720 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SIGMAR1Q99720 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SIGMAR1Q99720 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SIGMAR1Q99720 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SIGMAR1Q99720 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SIGMAR1Q99720 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SIGMAR1Q99720 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SIGMAR1Q99720 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SIGMAR1Q99720 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SIGMAR1Q99720 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SIGMAR1Q99720 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SIGMAR1Q99720 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SIGMAR1Q99720 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SIGMAR1Q99720 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SIGMAR1Q99720 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
SIGMAR1Q99720 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SIGMAR1Q99720 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SIGMAR1Q99720 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SIGMAR1Q99720 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SIGMAR1Q99720 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SIGMAR1Q99720 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SIGMAR1Q99720 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SIGMAR1Q99720 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SIGMAR1Q99720 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SIGMAR1Q99720 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SIGMAR1Q99720 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SIGMAR1Q99720 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SIGMAR1Q99720 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SIGMAR1Q99720 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SIGMAR1Q99720 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SIGMAR1Q99720 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SIGMAR1Q99720 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SIGMAR1Q99720 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SIGMAR1Q99720 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SIGMAR1Q99720 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SIGMAR1Q99720 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SIGMAR1Q99720 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SIGMAR1Q99720 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SIGMAR1Q99720 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SIGMAR1Q99720 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SIGMAR1Q99720 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC13.15□□□□□ -0.31
SIGMAR1Q99720 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
SIGMAR1Q99720 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SIGMAR1Q99720 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
SIGMAR1Q99720 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SIGMAR1Q99720 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SIGMAR1Q99720 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SIGMAR1Q99720 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SIGMAR1Q99720 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SIGMAR1Q99720 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SIGMAR1Q99720 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SIGMAR1Q99720 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SIGMAR1Q99720 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
SIGMAR1Q99720 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SIGMAR1Q99720 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SIGMAR1Q99720 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SIGMAR1Q99720 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SIGMAR1Q99720 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SIGMAR1Q99720 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SIGMAR1Q99720 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SIGMAR1Q99720 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SIGMAR1Q99720 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SIGMAR1Q99720 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SIGMAR1Q99720 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SIGMAR1Q99720 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SIGMAR1Q99720 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SIGMAR1Q99720 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SIGMAR1Q99720 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SIGMAR1Q99720 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SIGMAR1Q99720 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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