Protein–RNA interactions for Protein: Q96S52

PIGS, GPI transamidase component PIG-S, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIGSQ96S52 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PIGSQ96S52 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PIGSQ96S52 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PIGSQ96S52 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PIGSQ96S52 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PIGSQ96S52 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PIGSQ96S52 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
PIGSQ96S52 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PIGSQ96S52 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PIGSQ96S52 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PIGSQ96S52 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PIGSQ96S52 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PIGSQ96S52 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PIGSQ96S52 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PIGSQ96S52 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PIGSQ96S52 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PIGSQ96S52 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PIGSQ96S52 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PIGSQ96S52 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PIGSQ96S52 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PIGSQ96S52 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PIGSQ96S52 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PIGSQ96S52 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PIGSQ96S52 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PIGSQ96S52 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PIGSQ96S52 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PIGSQ96S52 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PIGSQ96S52 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PIGSQ96S52 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PIGSQ96S52 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PIGSQ96S52 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PIGSQ96S52 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PIGSQ96S52 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PIGSQ96S52 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PIGSQ96S52 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PIGSQ96S52 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PIGSQ96S52 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PIGSQ96S52 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PIGSQ96S52 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PIGSQ96S52 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PIGSQ96S52 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PIGSQ96S52 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PIGSQ96S52 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PIGSQ96S52 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PIGSQ96S52 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PIGSQ96S52 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PIGSQ96S52 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PIGSQ96S52 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PIGSQ96S52 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PIGSQ96S52 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PIGSQ96S52 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PIGSQ96S52 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PIGSQ96S52 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PIGSQ96S52 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PIGSQ96S52 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PIGSQ96S52 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PIGSQ96S52 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PIGSQ96S52 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PIGSQ96S52 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PIGSQ96S52 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PIGSQ96S52 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PIGSQ96S52 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PIGSQ96S52 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PIGSQ96S52 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PIGSQ96S52 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PIGSQ96S52 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PIGSQ96S52 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PIGSQ96S52 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PIGSQ96S52 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PIGSQ96S52 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PIGSQ96S52 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PIGSQ96S52 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PIGSQ96S52 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PIGSQ96S52 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PIGSQ96S52 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PIGSQ96S52 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PIGSQ96S52 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PIGSQ96S52 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PIGSQ96S52 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PIGSQ96S52 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PIGSQ96S52 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PIGSQ96S52 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PIGSQ96S52 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PIGSQ96S52 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PIGSQ96S52 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PIGSQ96S52 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PIGSQ96S52 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PIGSQ96S52 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PIGSQ96S52 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PIGSQ96S52 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PIGSQ96S52 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PIGSQ96S52 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PIGSQ96S52 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PIGSQ96S52 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PIGSQ96S52 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PIGSQ96S52 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PIGSQ96S52 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PIGSQ96S52 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PIGSQ96S52 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PIGSQ96S52 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms