Protein–RNA interactions for Protein: Q96QF0

RAB3IP, Rab-3A-interacting protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3IPQ96QF0 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RAB3IPQ96QF0 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RAB3IPQ96QF0 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RAB3IPQ96QF0 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
RAB3IPQ96QF0 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RAB3IPQ96QF0 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RAB3IPQ96QF0 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RAB3IPQ96QF0 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RAB3IPQ96QF0 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RAB3IPQ96QF0 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RAB3IPQ96QF0 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
RAB3IPQ96QF0 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RAB3IPQ96QF0 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RAB3IPQ96QF0 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RAB3IPQ96QF0 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RAB3IPQ96QF0 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RAB3IPQ96QF0 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RAB3IPQ96QF0 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RAB3IPQ96QF0 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RAB3IPQ96QF0 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RAB3IPQ96QF0 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RAB3IPQ96QF0 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RAB3IPQ96QF0 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RAB3IPQ96QF0 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RAB3IPQ96QF0 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RAB3IPQ96QF0 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RAB3IPQ96QF0 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RAB3IPQ96QF0 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
RAB3IPQ96QF0 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RAB3IPQ96QF0 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RAB3IPQ96QF0 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
RAB3IPQ96QF0 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RAB3IPQ96QF0 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RAB3IPQ96QF0 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RAB3IPQ96QF0 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RAB3IPQ96QF0 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RAB3IPQ96QF0 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RAB3IPQ96QF0 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RAB3IPQ96QF0 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RAB3IPQ96QF0 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RAB3IPQ96QF0 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RAB3IPQ96QF0 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RAB3IPQ96QF0 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RAB3IPQ96QF0 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RAB3IPQ96QF0 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RAB3IPQ96QF0 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RAB3IPQ96QF0 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RAB3IPQ96QF0 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RAB3IPQ96QF0 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RAB3IPQ96QF0 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RAB3IPQ96QF0 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RAB3IPQ96QF0 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RAB3IPQ96QF0 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
RAB3IPQ96QF0 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
RAB3IPQ96QF0 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RAB3IPQ96QF0 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RAB3IPQ96QF0 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RAB3IPQ96QF0 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RAB3IPQ96QF0 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RAB3IPQ96QF0 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RAB3IPQ96QF0 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RAB3IPQ96QF0 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RAB3IPQ96QF0 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RAB3IPQ96QF0 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RAB3IPQ96QF0 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RAB3IPQ96QF0 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RAB3IPQ96QF0 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RAB3IPQ96QF0 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RAB3IPQ96QF0 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RAB3IPQ96QF0 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RAB3IPQ96QF0 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RAB3IPQ96QF0 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RAB3IPQ96QF0 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
RAB3IPQ96QF0 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RAB3IPQ96QF0 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RAB3IPQ96QF0 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RAB3IPQ96QF0 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RAB3IPQ96QF0 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RAB3IPQ96QF0 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RAB3IPQ96QF0 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RAB3IPQ96QF0 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RAB3IPQ96QF0 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RAB3IPQ96QF0 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RAB3IPQ96QF0 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RAB3IPQ96QF0 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RAB3IPQ96QF0 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RAB3IPQ96QF0 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RAB3IPQ96QF0 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RAB3IPQ96QF0 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RAB3IPQ96QF0 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
RAB3IPQ96QF0 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RAB3IPQ96QF0 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RAB3IPQ96QF0 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RAB3IPQ96QF0 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RAB3IPQ96QF0 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RAB3IPQ96QF0 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RAB3IPQ96QF0 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RAB3IPQ96QF0 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
RAB3IPQ96QF0 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
RAB3IPQ96QF0 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.8 ms