Protein–RNA interactions for Protein: Q96NL0

RUNDC3B, RUN domain-containing protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNDC3BQ96NL0 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RUNDC3BQ96NL0 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RUNDC3BQ96NL0 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RUNDC3BQ96NL0 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RUNDC3BQ96NL0 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RUNDC3BQ96NL0 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RUNDC3BQ96NL0 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RUNDC3BQ96NL0 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RUNDC3BQ96NL0 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RUNDC3BQ96NL0 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RUNDC3BQ96NL0 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RUNDC3BQ96NL0 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RUNDC3BQ96NL0 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RUNDC3BQ96NL0 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RUNDC3BQ96NL0 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RUNDC3BQ96NL0 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RUNDC3BQ96NL0 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RUNDC3BQ96NL0 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RUNDC3BQ96NL0 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RUNDC3BQ96NL0 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RUNDC3BQ96NL0 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RUNDC3BQ96NL0 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RUNDC3BQ96NL0 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RUNDC3BQ96NL0 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RUNDC3BQ96NL0 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
RUNDC3BQ96NL0 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RUNDC3BQ96NL0 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RUNDC3BQ96NL0 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RUNDC3BQ96NL0 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RUNDC3BQ96NL0 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RUNDC3BQ96NL0 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
RUNDC3BQ96NL0 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RUNDC3BQ96NL0 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RUNDC3BQ96NL0 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RUNDC3BQ96NL0 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RUNDC3BQ96NL0 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RUNDC3BQ96NL0 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RUNDC3BQ96NL0 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RUNDC3BQ96NL0 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RUNDC3BQ96NL0 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RUNDC3BQ96NL0 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RUNDC3BQ96NL0 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RUNDC3BQ96NL0 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RUNDC3BQ96NL0 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RUNDC3BQ96NL0 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RUNDC3BQ96NL0 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RUNDC3BQ96NL0 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
RUNDC3BQ96NL0 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RUNDC3BQ96NL0 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RUNDC3BQ96NL0 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RUNDC3BQ96NL0 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RUNDC3BQ96NL0 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RUNDC3BQ96NL0 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RUNDC3BQ96NL0 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RUNDC3BQ96NL0 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RUNDC3BQ96NL0 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RUNDC3BQ96NL0 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RUNDC3BQ96NL0 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RUNDC3BQ96NL0 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RUNDC3BQ96NL0 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RUNDC3BQ96NL0 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RUNDC3BQ96NL0 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RUNDC3BQ96NL0 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RUNDC3BQ96NL0 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RUNDC3BQ96NL0 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RUNDC3BQ96NL0 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RUNDC3BQ96NL0 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RUNDC3BQ96NL0 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RUNDC3BQ96NL0 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RUNDC3BQ96NL0 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RUNDC3BQ96NL0 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RUNDC3BQ96NL0 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RUNDC3BQ96NL0 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RUNDC3BQ96NL0 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RUNDC3BQ96NL0 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RUNDC3BQ96NL0 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RUNDC3BQ96NL0 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RUNDC3BQ96NL0 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RUNDC3BQ96NL0 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RUNDC3BQ96NL0 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RUNDC3BQ96NL0 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RUNDC3BQ96NL0 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RUNDC3BQ96NL0 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RUNDC3BQ96NL0 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RUNDC3BQ96NL0 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RUNDC3BQ96NL0 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RUNDC3BQ96NL0 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RUNDC3BQ96NL0 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RUNDC3BQ96NL0 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
RUNDC3BQ96NL0 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RUNDC3BQ96NL0 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RUNDC3BQ96NL0 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RUNDC3BQ96NL0 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RUNDC3BQ96NL0 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RUNDC3BQ96NL0 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RUNDC3BQ96NL0 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RUNDC3BQ96NL0 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RUNDC3BQ96NL0 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RUNDC3BQ96NL0 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RUNDC3BQ96NL0 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms