Protein–RNA interactions for Protein: Q96JS3

PGBD1, PiggyBac transposable element-derived protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGBD1Q96JS3 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PGBD1Q96JS3 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PGBD1Q96JS3 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PGBD1Q96JS3 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PGBD1Q96JS3 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PGBD1Q96JS3 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PGBD1Q96JS3 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PGBD1Q96JS3 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PGBD1Q96JS3 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PGBD1Q96JS3 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PGBD1Q96JS3 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PGBD1Q96JS3 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PGBD1Q96JS3 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PGBD1Q96JS3 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PGBD1Q96JS3 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PGBD1Q96JS3 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PGBD1Q96JS3 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PGBD1Q96JS3 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PGBD1Q96JS3 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PGBD1Q96JS3 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PGBD1Q96JS3 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PGBD1Q96JS3 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PGBD1Q96JS3 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PGBD1Q96JS3 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PGBD1Q96JS3 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PGBD1Q96JS3 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PGBD1Q96JS3 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PGBD1Q96JS3 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PGBD1Q96JS3 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PGBD1Q96JS3 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PGBD1Q96JS3 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PGBD1Q96JS3 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PGBD1Q96JS3 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PGBD1Q96JS3 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PGBD1Q96JS3 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PGBD1Q96JS3 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PGBD1Q96JS3 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PGBD1Q96JS3 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PGBD1Q96JS3 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PGBD1Q96JS3 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PGBD1Q96JS3 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PGBD1Q96JS3 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PGBD1Q96JS3 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PGBD1Q96JS3 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PGBD1Q96JS3 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PGBD1Q96JS3 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PGBD1Q96JS3 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PGBD1Q96JS3 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PGBD1Q96JS3 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PGBD1Q96JS3 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PGBD1Q96JS3 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PGBD1Q96JS3 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PGBD1Q96JS3 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PGBD1Q96JS3 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PGBD1Q96JS3 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PGBD1Q96JS3 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PGBD1Q96JS3 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PGBD1Q96JS3 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PGBD1Q96JS3 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PGBD1Q96JS3 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PGBD1Q96JS3 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PGBD1Q96JS3 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PGBD1Q96JS3 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PGBD1Q96JS3 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PGBD1Q96JS3 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PGBD1Q96JS3 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PGBD1Q96JS3 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PGBD1Q96JS3 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PGBD1Q96JS3 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PGBD1Q96JS3 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PGBD1Q96JS3 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PGBD1Q96JS3 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PGBD1Q96JS3 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PGBD1Q96JS3 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PGBD1Q96JS3 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PGBD1Q96JS3 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PGBD1Q96JS3 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PGBD1Q96JS3 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PGBD1Q96JS3 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PGBD1Q96JS3 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
PGBD1Q96JS3 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PGBD1Q96JS3 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PGBD1Q96JS3 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PGBD1Q96JS3 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PGBD1Q96JS3 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PGBD1Q96JS3 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PGBD1Q96JS3 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PGBD1Q96JS3 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PGBD1Q96JS3 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PGBD1Q96JS3 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PGBD1Q96JS3 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PGBD1Q96JS3 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PGBD1Q96JS3 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PGBD1Q96JS3 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PGBD1Q96JS3 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PGBD1Q96JS3 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PGBD1Q96JS3 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PGBD1Q96JS3 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PGBD1Q96JS3 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PGBD1Q96JS3 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms