Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

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Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GTF3C6Q969F1 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GTF3C6Q969F1 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GTF3C6Q969F1 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GTF3C6Q969F1 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GTF3C6Q969F1 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GTF3C6Q969F1 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GTF3C6Q969F1 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GTF3C6Q969F1 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
GTF3C6Q969F1 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GTF3C6Q969F1 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GTF3C6Q969F1 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GTF3C6Q969F1 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GTF3C6Q969F1 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GTF3C6Q969F1 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GTF3C6Q969F1 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GTF3C6Q969F1 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
GTF3C6Q969F1 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GTF3C6Q969F1 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GTF3C6Q969F1 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GTF3C6Q969F1 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GTF3C6Q969F1 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GTF3C6Q969F1 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GTF3C6Q969F1 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GTF3C6Q969F1 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GTF3C6Q969F1 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GTF3C6Q969F1 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GTF3C6Q969F1 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GTF3C6Q969F1 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GTF3C6Q969F1 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GTF3C6Q969F1 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GTF3C6Q969F1 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GTF3C6Q969F1 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GTF3C6Q969F1 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GTF3C6Q969F1 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GTF3C6Q969F1 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GTF3C6Q969F1 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GTF3C6Q969F1 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GTF3C6Q969F1 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GTF3C6Q969F1 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GTF3C6Q969F1 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GTF3C6Q969F1 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GTF3C6Q969F1 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GTF3C6Q969F1 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GTF3C6Q969F1 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GTF3C6Q969F1 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GTF3C6Q969F1 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GTF3C6Q969F1 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GTF3C6Q969F1 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GTF3C6Q969F1 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GTF3C6Q969F1 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GTF3C6Q969F1 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GTF3C6Q969F1 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GTF3C6Q969F1 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GTF3C6Q969F1 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GTF3C6Q969F1 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GTF3C6Q969F1 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GTF3C6Q969F1 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GTF3C6Q969F1 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
GTF3C6Q969F1 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GTF3C6Q969F1 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GTF3C6Q969F1 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GTF3C6Q969F1 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GTF3C6Q969F1 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GTF3C6Q969F1 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GTF3C6Q969F1 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GTF3C6Q969F1 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
GTF3C6Q969F1 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GTF3C6Q969F1 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GTF3C6Q969F1 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GTF3C6Q969F1 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GTF3C6Q969F1 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GTF3C6Q969F1 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GTF3C6Q969F1 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GTF3C6Q969F1 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GTF3C6Q969F1 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GTF3C6Q969F1 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GTF3C6Q969F1 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GTF3C6Q969F1 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GTF3C6Q969F1 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GTF3C6Q969F1 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GTF3C6Q969F1 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GTF3C6Q969F1 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GTF3C6Q969F1 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GTF3C6Q969F1 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GTF3C6Q969F1 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GTF3C6Q969F1 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GTF3C6Q969F1 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GTF3C6Q969F1 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
GTF3C6Q969F1 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
GTF3C6Q969F1 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
GTF3C6Q969F1 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
GTF3C6Q969F1 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
GTF3C6Q969F1 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
GTF3C6Q969F1 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
GTF3C6Q969F1 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
GTF3C6Q969F1 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
GTF3C6Q969F1 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
GTF3C6Q969F1 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GTF3C6Q969F1 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
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