Protein–RNA interactions for Protein: Q8IUI4

SNX29P2, Putative protein SNX29P2, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX29P2Q8IUI4 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SNX29P2Q8IUI4 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SNX29P2Q8IUI4 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SNX29P2Q8IUI4 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SNX29P2Q8IUI4 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SNX29P2Q8IUI4 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SNX29P2Q8IUI4 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SNX29P2Q8IUI4 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SNX29P2Q8IUI4 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SNX29P2Q8IUI4 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SNX29P2Q8IUI4 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SNX29P2Q8IUI4 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SNX29P2Q8IUI4 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SNX29P2Q8IUI4 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SNX29P2Q8IUI4 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SNX29P2Q8IUI4 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SNX29P2Q8IUI4 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SNX29P2Q8IUI4 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SNX29P2Q8IUI4 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SNX29P2Q8IUI4 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SNX29P2Q8IUI4 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SNX29P2Q8IUI4 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SNX29P2Q8IUI4 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SNX29P2Q8IUI4 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SNX29P2Q8IUI4 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SNX29P2Q8IUI4 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SNX29P2Q8IUI4 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SNX29P2Q8IUI4 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SNX29P2Q8IUI4 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SNX29P2Q8IUI4 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SNX29P2Q8IUI4 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SNX29P2Q8IUI4 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
SNX29P2Q8IUI4 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SNX29P2Q8IUI4 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SNX29P2Q8IUI4 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
SNX29P2Q8IUI4 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SNX29P2Q8IUI4 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SNX29P2Q8IUI4 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SNX29P2Q8IUI4 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SNX29P2Q8IUI4 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
SNX29P2Q8IUI4 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SNX29P2Q8IUI4 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SNX29P2Q8IUI4 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SNX29P2Q8IUI4 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SNX29P2Q8IUI4 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SNX29P2Q8IUI4 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SNX29P2Q8IUI4 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SNX29P2Q8IUI4 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SNX29P2Q8IUI4 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SNX29P2Q8IUI4 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SNX29P2Q8IUI4 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SNX29P2Q8IUI4 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SNX29P2Q8IUI4 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SNX29P2Q8IUI4 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SNX29P2Q8IUI4 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SNX29P2Q8IUI4 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SNX29P2Q8IUI4 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SNX29P2Q8IUI4 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SNX29P2Q8IUI4 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SNX29P2Q8IUI4 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SNX29P2Q8IUI4 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SNX29P2Q8IUI4 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SNX29P2Q8IUI4 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SNX29P2Q8IUI4 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SNX29P2Q8IUI4 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SNX29P2Q8IUI4 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SNX29P2Q8IUI4 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SNX29P2Q8IUI4 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SNX29P2Q8IUI4 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SNX29P2Q8IUI4 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SNX29P2Q8IUI4 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SNX29P2Q8IUI4 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SNX29P2Q8IUI4 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SNX29P2Q8IUI4 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SNX29P2Q8IUI4 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SNX29P2Q8IUI4 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SNX29P2Q8IUI4 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SNX29P2Q8IUI4 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SNX29P2Q8IUI4 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNX29P2Q8IUI4 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNX29P2Q8IUI4 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNX29P2Q8IUI4 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNX29P2Q8IUI4 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNX29P2Q8IUI4 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNX29P2Q8IUI4 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNX29P2Q8IUI4 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNX29P2Q8IUI4 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNX29P2Q8IUI4 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
SNX29P2Q8IUI4 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNX29P2Q8IUI4 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNX29P2Q8IUI4 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNX29P2Q8IUI4 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
SNX29P2Q8IUI4 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNX29P2Q8IUI4 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNX29P2Q8IUI4 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNX29P2Q8IUI4 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNX29P2Q8IUI4 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNX29P2Q8IUI4 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNX29P2Q8IUI4 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNX29P2Q8IUI4 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms