Protein–RNA interactions for Protein: Q86YR7

MCF2L2, Probable guanine nucleotide exchange factor MCF2L2, humanhuman

Predictions only

Length 1,114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCF2L2Q86YR7 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MCF2L2Q86YR7 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MCF2L2Q86YR7 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MCF2L2Q86YR7 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MCF2L2Q86YR7 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MCF2L2Q86YR7 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MCF2L2Q86YR7 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MCF2L2Q86YR7 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MCF2L2Q86YR7 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MCF2L2Q86YR7 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MCF2L2Q86YR7 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MCF2L2Q86YR7 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MCF2L2Q86YR7 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MCF2L2Q86YR7 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MCF2L2Q86YR7 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MCF2L2Q86YR7 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MCF2L2Q86YR7 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MCF2L2Q86YR7 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MCF2L2Q86YR7 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MCF2L2Q86YR7 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MCF2L2Q86YR7 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
MCF2L2Q86YR7 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
MCF2L2Q86YR7 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MCF2L2Q86YR7 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MCF2L2Q86YR7 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MCF2L2Q86YR7 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MCF2L2Q86YR7 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MCF2L2Q86YR7 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MCF2L2Q86YR7 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MCF2L2Q86YR7 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MCF2L2Q86YR7 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MCF2L2Q86YR7 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MCF2L2Q86YR7 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MCF2L2Q86YR7 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MCF2L2Q86YR7 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MCF2L2Q86YR7 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MCF2L2Q86YR7 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MCF2L2Q86YR7 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MCF2L2Q86YR7 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MCF2L2Q86YR7 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MCF2L2Q86YR7 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MCF2L2Q86YR7 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MCF2L2Q86YR7 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
MCF2L2Q86YR7 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MCF2L2Q86YR7 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MCF2L2Q86YR7 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MCF2L2Q86YR7 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MCF2L2Q86YR7 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MCF2L2Q86YR7 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MCF2L2Q86YR7 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MCF2L2Q86YR7 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MCF2L2Q86YR7 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MCF2L2Q86YR7 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MCF2L2Q86YR7 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MCF2L2Q86YR7 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MCF2L2Q86YR7 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
MCF2L2Q86YR7 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
MCF2L2Q86YR7 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MCF2L2Q86YR7 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MCF2L2Q86YR7 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MCF2L2Q86YR7 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MCF2L2Q86YR7 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MCF2L2Q86YR7 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MCF2L2Q86YR7 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MCF2L2Q86YR7 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MCF2L2Q86YR7 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
MCF2L2Q86YR7 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MCF2L2Q86YR7 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MCF2L2Q86YR7 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
MCF2L2Q86YR7 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
MCF2L2Q86YR7 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
MCF2L2Q86YR7 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
MCF2L2Q86YR7 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
MCF2L2Q86YR7 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
MCF2L2Q86YR7 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MCF2L2Q86YR7 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MCF2L2Q86YR7 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MCF2L2Q86YR7 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MCF2L2Q86YR7 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MCF2L2Q86YR7 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MCF2L2Q86YR7 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MCF2L2Q86YR7 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MCF2L2Q86YR7 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MCF2L2Q86YR7 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MCF2L2Q86YR7 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MCF2L2Q86YR7 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MCF2L2Q86YR7 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MCF2L2Q86YR7 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MCF2L2Q86YR7 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MCF2L2Q86YR7 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MCF2L2Q86YR7 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MCF2L2Q86YR7 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
MCF2L2Q86YR7 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MCF2L2Q86YR7 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MCF2L2Q86YR7 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
MCF2L2Q86YR7 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MCF2L2Q86YR7 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MCF2L2Q86YR7 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MCF2L2Q86YR7 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MCF2L2Q86YR7 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms